在塞纳河这条受到水质污染问题关注的河流上，已经举办了男女铁人三项、混合铁人三项接力以及女子公开水域游泳（10公里赛）等赛事，而男子公开水域游泳比赛则计划在当地时间8月9日举行。

由于塞纳河大肠杆菌等细菌浓度较高，出于健康考虑，铁人三项和公开水域游泳的官方训练以及男子铁人三项比赛曾一度被推迟。尽管如此，大会组织委员会和国际铁人三项联盟还是决定在水质低于标准值的情况下继续进行各项比赛。

在这样的背景下，法国媒体Mediapart获取了组织委员会频繁进行的水质检测结果，并揭露了“主办方不愿公开的‘不利数字’。在10天中，只有2天水质是合格的。塞纳河的污染过于严重。”据Mediapart报道，自7月26日奥运会开幕以来，只有20%的日子，即10天中只有2天，塞纳河的水质达到了国际铁人三项联盟设定的标准。

据Mediapart报道，这两天分别是7月30日和31日，而男女铁人三项比赛正是在31日举行的，水质当时是达标的。然而，在8月5日举行的混合铁人三项接力赛时，水质并未达到标准。

8月5日铁人三项混合接力赛当天，组织方在四个采样点之一的Groin Kouyou港口测得每100毫升水中含有436个菌落形成单位（CFU）的肠球菌。这个数值“已经超过了国际铁人三项联盟设定的‘400CFU/100mL’的限制要求。

此外，Mediapart还提到，塞纳河的水质在巴黎市长安妮·伊达尔戈于7月17日潜水时也是不达标的。频繁的降雨和下水道状况不佳被认为是水质污染的原因。

每项比赛之后，都有几名运动员出现了身体不适的情况，但目前尚不清楚这与塞纳河的水质污染是否有直接关联。