《中国医院专科综合排行榜》中对于各个医院专科的量化来自两个方面，分别是声誉和科研。如果不考虑一个医院的科研水平，仅对各医院专科的声誉进行对比，首都北京近乎碾压其他地区。
在《中国医院专科声誉排行榜》中，总计45类专科参与对比，共有135家医院450个科室进入前十（仅统计各专科前十名）。北京地区专科声誉排名第一的数量达到31个，其中协和医院独揽11项第一，北医三院和解放军总医院并列第二，各有3个科室排名全国第一。
北京没有获得排名第一的科室几乎没有急重病科室，比如眼科、呼吸科、检验科、整形、消化、皮肤、小儿内科等等。而像重症医学、肿瘤学、血液科、神经外科、急诊医学、心血管病等常见急重病声誉排名第一的科室全部位于北京的医院。
除了北京、上海地区的医院科室声誉排名同样靠前。各专科前三，北京有59个科室，而上海也多达32个，之后是四川达到15个。
