EGFR20插入突变:PCR试剂盒漏检率极高,必须NGS!

张勇提醒您 2024-02-21 10:51:40

除了A763_Y764ins突变外, EGFR20插入突变对经典的1-3代Tki耐药。因此以往治疗多为化疗为主。但随着近年EGFR20插入位点新药的上市,检测的重要性得到了更多的重视。今天来一起看看JTO这篇EGFR20插入检测方法的文章“Distribution and Detectability of EGFR Exon 20 Insertion Variants in Non-small Cell Lung Cancer”,同时看下我们的解决方案。

https://doi.org/10.1016/j.jtho.2023.01.086

EGFR20插入占有所有EGFR突变的5-10%。众所周知,PCR方法对于EGFR19和21突变检测快速,但对20插入的漏检率高;而NGS方法价格较贵且耗时较长,大规模使用受到经济条件的限制,导致目前临床上EGFR20插入的检出率偏低。

本文旨在比较PCR和NGS两种方法对EGFR20插入突变检出率的差别,来给临床检测提出建议。

本文包含了1项全球多中心研究和4个真实世界数据库,纳入任何一种方法检测出EGFR20插入的患者;而且这些患者同时接受NGS检测方法和另外一种检测方法(PCR试剂盒),这样可以来比较不同方法间的差异。

1项研究为莫博赛替尼的全球研究,4个数据库分别为德国、日本、GENIE全球数据库和美国。总共纳入636例患者,亚裔人群也不少,达到了192位。

本汇总研究用检测出104钟不同的EGFR20插入突变(比19和21突变复杂太多)。由于PCR先天不足,只能检测已位点,不能覆盖如此多的插入突变而导致漏检。

如果仅仅采用PCR这一种方法,总检出率只有15.3%至45.1%。也就是说总体上至少有>54.9%的EGFR20插入突变会被PCR试剂盒漏检。

下图:橙色为PCR可检测位点,蓝色为所有位点。

图中可以看到,PCR试剂盒只可以检测常见的7个位点,会导致发生频率不高的位点漏检。包括对经典Tki敏感的A763-Y764插入,PCR也无法检测出来。

从个各个EGFR20插入的分布图可以看出,最常见的突变为A767-V769ASV和S768-D770SVD。可以由PCR检出,其他相对低频的突变,很多情况下PCR就无能为力了。

总结下,EGFR20插入突变位点众多,PCR试剂盒只能覆盖常见突变,总体漏检率>50%。需要NGS作为补充。

解决方案:

那么临床上对于临床首诊的患者,应该采取那种方案呢?中山医院的解决方案为:在患者知情,费用允许的情况下,同时做PCR和NGS。这样虽然涉及重复检查,但确实是解决临床问题的重要方法。

PCR试剂盒可以快速检测出常见突变,最快3天内可以得到结果。如果患者发现有EGFR21或者19突变,PCR试剂盒可以很快高效地检测出来,医生可以迅速地给予患者治疗。

而如果PCR试剂盒没有发现突变,那么再等待NGS的结果,这样可以保证最大程度不漏检。

不仅对于EGFR20插入突变,对于融合基因ALK,ROS1,RET等,也存在PCR试剂盒漏检,NGS检测出的问题。

这是我们经治的一位女性初诊肺癌患者,起初PCR试剂盒没有发现突变,患者一度灰心没有了靶向治疗的机会,而后续的NGS检测出EGFR20insA763-Y764突变。

PCR试剂盒未检出764-764突变

NGS检出EGFR20插入763-764突变,为极少数对经典Tki敏感的20插入突变。

这个罕见靶点对经典Tki敏感,因此给予伏美替尼80mg治疗后肿瘤缩小PR,目前持续缓解6个月。本例为典型的NGS给EGFR20插入带来治疗机会的病例。

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