一项新的研究表明,科学家们已经发现了数百种可能导致癌症的基因。
癌症通常是由我们基因编码的某种变化引发的,这种变化干扰了细胞管理其生长的能力。针对这些破坏进行量身定制的治疗,通常可以防止肿瘤扩大到失控的程度。
迄今为止,已知超过600个基因在其序列被突变破坏时会导致肿瘤。然而,在基因转录和最终产物之间的通路上,还有其他的癌症发生的方式。
该领域之前的大多数研究关注的是DNA本身固有的异常,而这项研究关注的是DNA指令传递到身体其他部位时发生的异常。
来自西班牙巴塞罗那科学技术研究所(BIST)的研究人员使用精心构建的算法来寻找与外显子相关的遗传密码中的错误:外显子是基因序列中直接转化为蛋白质的部分。
基因的非编码部分,称为内含子,通常在基因的DNA转录成RNA版本的过程中被移除,这一过程称为剪接。癌细胞可以干扰剪接,从正常的、未突变的蛋白质基因中产生突变的蛋白质。
该团队使用精心构建的算法来识别813个基因,这些基因在拼接时可以促进癌症的生长。
在现有的626种已知突变致癌基因的基础上,这一广泛的新类别扩大了我们的致癌基因清单。事实上,只有大约十分之一的“剪接”类已经被包括在最广泛使用的癌症突变数据库中,该数据库记录了可以通过突变驱动癌症生长的基因。
“当考虑到像剪接这样的非突变机制时,我们认为控制癌症的潜在基因靶点可能会增加一倍,”BIST生物学家Miquel Anglada-Girotto说。
“这些不是经典的致癌基因,而是代表了一类全新的潜在癌症驱动因素,可以单独针对它们,也可以与现有策略协同作用。”
研究人员的算法,称为Spotter,能够从大量的遗传数据中挖掘出剪接事件,这些剪接事件可能会给癌症提供更好的生长机会。在对组织样本进行的小规模实验室测试中,靶向这些外显子确实限制了样本中癌症的生长。
“Spotter不仅可以识别潜在的癌症驱动外显子,然后我们可以追溯到基因,而且还可以在任何给定的癌症样本中对哪些外显子比其他外显子更重要进行排序,”Anglada-Girotto说。
识别这些外显子的有用性也不止于此:进一步的分析,结合这项研究的数据和药物治疗结果的数据库,表明剪接的变化可以帮助预测不同患者对同一药物的不同反应。
虽然在我们能够定期突出和瞄准基因内的外显子之前还有很多工作要做,但这项研究表明,这是一个很好的机会。我们拥有的抗癌武器越多越好。
“这是一个令人难以置信的令人兴奋的新领域,”Anglada-Girotto说。
这项研究发表在《自然通讯》杂志上。
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