《心理罪》第二季改编自雷米的同名系列小说中的《教化场》和《暗河》，原班人马主演

绿藤市连续发生两起命案，受害人均为网络女主播。犯罪分子冒充外卖送餐员入室杀人，手段残忍血腥。女警唐悠通过数据分析，推断主播桑楠楠是凶手，然而桑楠楠被绑的直播视频却突然传出。

方木出场后怀疑凶手是沈湘，可话音刚落沈湘就死亡了。最后方木根据“眼镜”“身高”“沈湘身上的污迹”等线索，锁定沈湘的男朋友罗家海为嫌疑人，又通过沈湘的遗书和桑楠楠直播细节等发现，真正患 PTSD（创伤后应激障碍）的人其实是罗家海自己。

局长邢志森的女儿邢娜和同学在 KTV 被欺负，经理报案讹诈邢娜，邢娜找来邰伟帮忙，经理便怂了。之后邢至森为救邢娜中枪昏迷，邢娜也失踪了。方木和邰伟追查时，一桩拐卖妇女为客户二胎代孕的案件浮出水面。而在寻找邢娜的过程中，方木查明了这是以正义之名教化社会的连环催眠杀人案。

剧中的主要人物包括方木、邰伟、心理医生杨芸、警花唐悠等。方木是一名警察，具有敏锐的洞察力和分析能力；邰伟是经验丰富的刑警队长。新加入的心理医生杨芸和警花唐悠与方木、邰伟组成了新的破案团队。

然而，随着剧情的发展，一些隐藏的真相逐渐浮出水面。原来杨芸就是整容改名后的曲蕊，她是教化场成员之一。她因过去的经历产生了精神分裂，时而是心理医生杨芸，时而是电脑高手曲蕊。杨芸决心摧毁教化场，摆脱曲蕊的阴影，但她的真实身份最终还是被方木发现。

在心理诊所地下室的铁皮文件柜中，警方发现了三起教化案的所有资料，了解了案件的来龙去脉。曲蕊在十年前被美国家庭收养，因无法与人正常沟通，努力学习计算机技术，后被陈哲盯上。法医发现地下室焦尸骨头里有抗焦虑药物成份，与曲蕊特征相符，可认定教化场案已结，剩下的就是抓捕在逃的陈哲。

方木想到在地下室火场中，烧得扭曲变形的键盘里有一枚极似杨芸遗失的戒指，而杨芸在砂石厂丢失的戒指不可能出现在地下室，由此推断杨芸就是教化场成员、黑客 Q。

方木试探后，杨芸露出马脚。方木明白是杨芸暂时替代了催眠师 Z，催眠谭纪对梁泽昊实施教化，唐悠能轻易攻破黑客系统也是杨芸故意为之。

方木希望自己的猜测是错的，但事实残酷，杨芸并未否认。杨芸即曲蕊，她想开始新生活，却摆脱不了曲蕊的阴影，逐渐产生精神分裂。杨芸为摆脱阴影决心摧毁教化场，她配合诱捕陈哲并故意让唐悠获取更多信息。

而地下室的焦尸其实是周国清周教授，周教授自愿拯救杨芸的灵魂并赎罪，替换杨芸资料、服下大量抗焦虑药物后自焚，助杨芸彻底脱离教化场。

方木用爱帮助杨芸摆脱心理阴影，方木安慰曲蕊，让她宣泄出积压多年的恐惧，曲蕊消失，只剩杨芸。方木成功了，但他因杨芸的美工刀划伤失血过多昏迷。醒来后，方木从邰伟处得知杨芸已离开青藤市出国，他决定不再提起被杨芸刺伤的事，让秘密随教化场成为往事。

然而，从水塘逃脱的陈哲坐上一辆出租车，司机是陈哲的反面，代表着城市的光明，司机回身一枪，陈哲最终也受到了应有的惩罚。