1798年，法国拿破仑远征苏伊士地峡，随后通过一系列战斗，在金字塔下击败了埃及当地的马木留克/马穆鲁克军队，取得了对埃及地区的控制。但埃及作为奥斯曼帝国的名义行省，拿破仑的举动无异于向奥斯曼宣战！
但正如法国革命的督政府文件中所说的那样，拿破仑决心“在东方重塑法国的权威”，因为这是“与英格兰一较高下的决定性因素之一”。不过与俄罗斯沙皇亚历山大不同，拿破仑此时还并不想加速奥斯曼帝国的崩溃。在他看来，奥斯曼帝国自己就会走向灭亡。他对督政府表示，“我们会亲眼看到奥斯曼帝国的崩溃”。为了最大限度地利用这一点，他一方面努力在奥斯曼帝国版图内部为法国争取更多的商业和宗教方面的权益，另一方面试图从奥斯曼帝国手中夺走一个不听中央政府号令的行省——埃及。
拿破仑在此事上其实是受到了塔列朗（Talleyrand）的影响。塔列朗认为：夺取新的殖民地会给法国带来优势，而埃及就是潜在的新殖民地之一。此外，在开罗经商的法国商人也向政府陈情，他们希望把埃及变成在东方贸易线路上的重要中转站，以削弱英国人在印度的霸主地位。
于是，拿破仑在土伦集结了规模庞大的舰队和军队。对于这些部队的目的地和目标，人们议论纷纷。一开始，人们以为这支部队将是入侵英国的左路军。直到舰队于1798年4月起航向东进发，人们才意识到它的目标是入侵埃及！
督政府颁布给拿破仑的“命令”，实际上毫无疑问是拿破仑本人亲自起草的。命令说：“他要尽可能地夺取英国人在东方的领地，特别是摧毁他们在红海一带的所有据点；直插苏伊士地峡，采取必要手段确保法兰西共和国完全控制红海。”
拿破仑・波拿巴
拿破仑本人还要考察在那里开凿运河、连接红海和地中海的可能性。拿破仑一心想要追随亚历山大大帝的足迹，他的终极目标是让法国在印度取代蒸蒸日上的大英帝国的地位！由此，一场奥斯曼帝国和法国拿破仑的战争开始了......
开端最初法国拿破仑进攻埃及，并非是要与奥斯曼为敌，只不过是为了切断英国与印度的交通线。所以他在进军埃及期间，不停地重申自己对法土联盟的尊重，小心翼翼地宣称他真正的敌人是马木留克军队，而不是奥斯曼土耳其人。
无论是当时的拿破仑・波拿巴，还是法国外交家夏尔・莫里斯・德・塔列朗-佩里戈尔，都以为奥斯曼帝国政府在埃及只剩下了象征性的权威，当地的权力早就落入了专横的马木留克集团手中。所以他们错误地以为奥斯曼土耳其人会默许法国人在埃及“镇压”马木留克。
但事实并非如此：早在1787年，埃及行省就又开始暂时服从奥斯曼帝国中央政府了，虽然当地马木留克势力仍然主导，但衰败中的奥斯曼人绝不会容忍有基督教军队肆意插入埃及这一伊斯兰世界的心脏地带！
因此为了奥斯曼帝国的利益和尊严，时任帝国苏丹的塞利姆三世必须出面主张自己对埃及的主权！于是奥斯曼帝国与俄罗斯和英格兰结盟并对法国宣战！而这场土法之间的战争也就不可避免了......
奥斯曼形势图
在奥斯曼土耳其对法国宣战后，留在伊斯坦布尔的法国大使便被送进了七塔监狱，另外一些法国人也被投进了其他监狱。作为法国死敌的英国人，则派舰队协助奥斯曼帝国各级政府在黎凡特地区的港口捉拿法国商人。
与此同时，一支俄罗斯舰队也从黑海驶入了博斯普鲁斯海峡，虽然奥斯曼与俄罗斯之间也是死敌，但这一次俄罗斯人却因为共同的敌人得到了体面的欢迎，苏丹本人还亲自登舰访问。接着这支舰队又与奥斯曼帝国海军的一支舰队会合，驶入地中海。这是俄罗斯的旗帜第一次、也是最后一次与新月旗一同飘扬！
随后俄罗斯与奥斯曼帝国的联合舰队从法国人手里夺走了爱奥尼亚群岛，并在那里建立一个听命于俄土两国的被保护国。然后它们甚至还联手帮助教皇在意大利沿岸地区对付拿破仑的盟友。
战争1798年5月19日，法国拿破仑率远征军3万余人、各类舰只350艘从土伦港出发，用计避开英国海军的封锁，于6月10日占领马耳他；7月2日攻占埃及亚历山大；随后猛扑开罗，于13日首次交战与埃及马木留克骑兵交战。
1798年7月1日，在埃及开罗金字塔之下，拿破仑率军大败马木留克部队，史称“埃及战役”！此战之后拿破仑威名远扬东方，被誉为“火炮之王”、“战争之神”。但与此同时，奥斯曼政府也决定对法国宣战，筹备大军准备收复埃及。
在拿破仑错误估计形势进军埃及后不久，他就犯了另一个错误：他过于相信法国庞大舰队的实力，对舰队的规模过于自信，高估了其能力和战术素养。于是法国舰队便在8月1日的阿布基尔海战中被英国名将纳尔逊将军所指挥的海军舰队歼灭，法军失去了海上补给。
虽然当时英国纳尔逊勋爵（Lord Nelson）的英国舰队规模很小，但实力却更强。他从那不勒斯出发来拦截法国舰队，但由于遇到了笼罩在克里特岛和非洲大陆之间的浓浓夜雾而未能得手，因此在战争一开始便没能阻止拿破仑在亚历山大港登陆。但纳尔逊随后捕捉到了停泊在阿布基尔湾（Aboukir Bay）的法国舰队，并将其歼灭！最终只有两艘法国船只设法逃走，但很快也被英国人俘获。这样一来，拿破仑的大军就被困在了埃及，没法回国。
当然拿破仑最终也没有选择回国，1799年2月，他的大军带着沉没船只上的水手和从马木留克中招募的新兵，约1.2万人马通过陆路进入了叙利亚。此时的拿破仑已经代表法国与奥斯曼帝国正式交战，所以他希望能够把奥斯曼帝国版图内对中央政府不满的各个阿拉伯省份吸引到他的麾下！甚至拿破仑还还夸下海口，宣称他的军队到仲夏时节就能抵达幼发拉底河，到秋天就能准备好向印度进军！就像拿破仑所崇拜的亚历山大大帝当年的路线一般，拿破仑也要效仿亚历山大建立不朽的功业！
于是，在北非的法军一路向东占领了叙利亚的加沙和雅法（Jaffa）之后，他又沿着曾经基督教十字军的足迹，向重要的要塞阿卡进军。一路上法军攻无不取，战无不胜，最终于3月20日围攻军事要地阿卡。
此时阿卡的总督是声名显赫的艾哈迈德・热扎（“屠夫”）帕夏（Ahmed Djezzar Pasha），此人有一支由阿尔巴尼亚人和波斯尼亚人组成的私人军队。虽然他一直对苏丹本人是一个威胁，但现在他却站出来统率他的叙利亚军队替苏丹来抗击异教徒。
西德尼・史密斯
拿破仑麾下的法军对阿卡要塞的围攻持续了两个月之久，期间英国人的制海权再一次妨碍了他的行动：一支为拿破仑运送急需的重炮的法国小船队被英国海军将领西德尼・史密斯爵士（Sir Sidney Smith）的舰队截获。
史密斯爵士让自己船上的炮手和陆战队登岸，然后通过海路为土耳其人送来了援军。援军中包括塞利姆三世苏丹通过军事改革后的部分新军，他们配备了火枪和刺刀，装备精良。
尽管拿破仑击败了从大马士革赶来的一支规模庞大的援军，但他却始终无法击败阿卡要塞内顽强抵抗的奥斯曼守军，并且英国海军还在近海使用舰炮轰击法军。由此拿破仑吞下了失败的苦果，说道：“这个不幸的要塞决定了东方的命运。”随后他被迫穿越沙漠撤回埃及，一路上损失惨重。
1799年6月。拿破仑率军返回了埃及，在埃及他又遇到了由西德尼・史密斯爵士的舰队从罗得岛护送来的第二支奥斯曼军队。于是他在阿布基尔的陆战中迅速击败了这支敌军。
当时法军端着刺刀向奥斯曼土耳其人进行冲锋，顺势把他们赶进了大海。成千上万的土耳其人溺死，海湾里漂满了他们的头巾。就这样，拿破仑又一次确立了他在马木留克人中的威望。
但由于英国海军的又又又一次阻挠，拿破仑短暂的东方帝国之梦还是永远破灭了。此时埃及的法军不仅失去海上支援和补给，并且从周围增援而至的奥斯曼军队更加加剧了法国人的艰难处境。
更为致命的是，此时的拿破仑刚刚得知了法国国内局势动荡的消息，因此不再准备继续耗在埃及，而是决定抛弃部队秘密返回法国。于是拿破仑把军队的指挥权交给了克莱贝尔将军（General Kléber），自己遂率随从500人左右偷偷坐船于10月9日返回了法国......
回到法国后，拿破仑设法把自己包装成了一个胜利的征服者，随后又把自己的精力放在了他的西方帝国之梦上：他发动政变推翻了督政府，并任命自己为第一执政。随后开启了拿破仑大帝的统治时代......
虽然拿破仑在法国取得了统治，但埃及的问题仍然存在，法国与奥斯曼帝国的战争尚未结束。就在埃及的法国远征军失去主帅和断绝支援之后，英土联军便增援埃及对其进行打击，法军大量减员。
1801年前后，在拉尔夫・阿伯克龙比爵士（Sir Ralph Abercromby）的率领下，一支英土联合远征军在埃及登陆，迫使士气低落的法军于8月投降，并在9月将他们送回了法国，至此历时3年多的法国远征埃及以失败而告终。
1802年，英法和法土分别签署了《亚眠条约》（Treaty of Amiens）。条约的内容对法国和奥斯曼帝国都很有利。尤其奥斯曼苏丹对埃及和其他地区的主权得到了认可，奥斯曼帝国政府派出的帕夏们也一度取代了马木留克的执政地位。英国军队也撤出了埃及。
至此，衰落中的奥斯曼土耳其帝国彻底从法国拿破仑手中夺回了埃及行省，这也是“西亚病夫”奥斯曼土耳其人在帝国瓦解前为数不多的胜利了。当然这个胜利的一多半功劳，还是由英国人所取得的......
虽然法国与奥斯曼之间1798年至1802年的战争告一段落，但欧洲更为持久的动荡仍在持续。拿破仑的越界行为让英国又一次在红海及更远地区采取了新的进取政策！
英国与亚丁当地的苏丹签署了一份和约，这份和约成了日后英国吞并亚丁的序曲。英国很清楚地表示，如果从埃及可以侵略印度，那么从印度也可以侵略埃及。英国在奥斯曼帝国其他属地的沿岸地区也采取了类似的预防措施。
在波斯湾，东印度公司把法国人逐出了阿曼，还在巴格达设立了常设机构。它取代了英国在巴士拉的领事馆，成了“驻土属阿拉伯地区的政治代理处”。拿破仑的失败激励了英国人，确保了他们的成功。
而根据短命的《亚眠条约》，法国被迫放弃了爱奥尼亚群岛和邻近的大陆地区。这一地区仍然处于俄罗斯和奥斯曼帝国的共同保护之下，俄罗斯掌管岛屿，奥斯曼帝国则管理大陆上的城镇和要塞。
此时，亚尼纳（Janina）的阿里帕夏已经窃取了许多城镇。这个可怕、狡诈而残忍的阿尔巴尼亚人拥有一支规模庞大的土匪武装。对于奥斯曼帝国来说，他是一个古怪的仆人。他消灭了邻近的大部分部落武装，包括叛乱的基督徒苏利奥人，从而在阿尔巴尼亚南部和伊庇鲁斯的内陆地区建立起了高度自治的统治。
当然在维护了帝国的尊严之后，奥斯曼帝国政府与法国再度进入和平状态，释放了关押的法国囚徒，恢复了法国人的财产。对法国的让步条约得以续签。在保留了原有条款的基础上，还给予了法国人在黑海经商航行的权利。
法国商业活动的迅速复苏则引起了俄国人和英国人的担忧。在经过三年的低谷期之后，法国人在伊斯坦布尔的威望也再度恢复了。有意思的是，拿破仑军队的迅速胜利和他在埃及采取的宽容政策都给法国加了分。两国之间的联盟又恢复到了以前的水平。法国向奥斯曼帝国新派了一位大使以巩固本国的影响力；而奥斯曼帝国新派到巴黎的大使则难以掩饰自己对法国一切事物的兴趣......
