1955年10月25日，李克农上将因感到头晕，想出门去散散步，结果刚刚迈出门槛，就一头栽倒在了地上，整个人陷入昏迷。

得知消息的周总理第一时间来到北京医院，指示医护人员全力进行抢救。8天之后，昏迷的李克农才清醒过来。医生确诊他为脑溢血重症。情况不容乐观，李克农的大脑受损严重，一度丧失了记忆。

稍有恢复之后，李克农就把工作重新捡了起来。他对家人说：“一个共产党员最大的痛苦，就是没有工作。”

此后，李克农主持了争取李宗仁夫妇由美国返回中国的工作，此时引起了周总理很高的评价。总理说：“公安部和调查部办了两件大事：公安部成功地改造了一个末代皇帝，调查部成功地争取了一个国民党代总统。”

到1961年，李克农给中央写信，称自己的身体已经基本恢复，可以逐步恢复工作了，请中央批准。中央批准了他的申请，这让他感到由衷的高兴。

然而，在接下来的两个月时间里，他却因为奔波于上海和北京之间元气大伤，刚恢复的身体出现了严重的咳嗽和气喘，严重的时候，李克农整夜都无法睡觉。

在身体遭到病魔摧残的同时，李克农的精神也先后遭到了两次沉重的打击。

首先是1961年1月6日，李克农的妻子赵瑛因病去世。赵瑛早在李克农从事地下斗争时期，就一直陪伴在李克农的左右，她不仅是李克农的妻子，也是他的革命战友。

1960年，赵瑛确诊癌症后，对医生说：“我的病已经无法治了，请你们不要浪费了，把那些药用给其他患病的同志吧！”由于她拒绝用药，病情迅速发展，仅仅6个月后，赵瑛就离开了人世。家人在整理她的衣物时，发现她贴身的衣裤上都是补丁，不禁潸然泪下。

赵瑛的去世，给了李克农非常沉重的打击。据李克农办公室的工作人员徐炎庐回忆，赵瑛去世后，李克农要求继续维持赵瑛生前的卧室布置情况，每天晚上睡觉前，他都要去那间卧室默默坐一会儿，鞠躬之后才去安睡。

这种深沉的同志加家人的关系，如今我们已经很难理解了。

在赵瑛病逝后2个月，李克农紧接着又遭遇了另外一个打击——挚友陈赓也去世了。

据《陈赓传》记载：之前不久在上海的时候，李克农和陈赓一起聚餐时，两人还商量着要把他们30年代在中央特科的历史回忆写出来，以弥补党史上的一段空白。现在，突然惊闻噩耗，李克农简直不能相信这是事实，大睁着双眼，很久很久没有说话，接着就患了重病，一年后也告别了人世。

陈赓大将是李克农的老上级，也是老战友，两人感情亲密，无话不谈，是绝对的知己好友。听到陈赓病逝的消息，李克农不顾自己的身体，坚持要去向陈赓的遗体告别，家人百般劝阻无效，只好扶着他去参加。

据《李克农传》记载，李克农上将素来以能饮著称，在外界有“酒豪”之称，但在陈赓去世后，李克农就很少很久了，他常常感慨：“陈赓死了，酒也没有味道了。”

1962年1月，北京召开了一次中央工作扩大会议，李克农抱病参加了这次会议。考虑到他的心脏病，大家都劝他不要参加了，但李克农却坚持要参加。

2月7日，李克农病情复发，被送入北京协和医院。2天之后，即1962年2月9日晚21时，李克农将军停止了呼吸。

当时，病房外大雪纷纷扬扬，苍天一片灰蒙蒙，似乎也在为这位伟大的将军送行……

2月13日，首都各界人士在中山堂为李克农举行了公祭大会，由周总理担任主祭，时任国务院副总理、解放军总参谋长的罗瑞卿宣读了悼词。

李克农将军的一生堪称传奇，他是我军中唯一一位没有任何带兵打仗经验，却获得开国上将军衔的人。不过，这并不代表李克农没有在军队里工作过，相反，他在军队中工作的时间是很长的。

李克农在1932年就被任命为红一方面军政治保卫局局长、红军工作部部部长。在长征路上，他具体负责敌情侦察和保卫中共中央机关安全的工作。

来到陕北后，李克农一度专门负责对张学良、东北军的工作，参与处理了西安事变。之后历任八路军驻上海、南京、桂林办事处处长，长江局秘书长、中央社会部副部长、情报部副部长等重要职务，是我党情报组织工作的重要领导者。

新中国成立后，李克农担任中央军委情报部部长，曾作为新中国的代表前往板门店参加停战谈判，为谈判期间中方代表团的总指挥和最高负责人。1953年，李克农又被任命为解放军副总参谋长……这些军中的履历都确保了他在1955年被授予开国上将的军衔。