IT之家12月26日消息,九江市农业科学院于12月24日发布博文,宣布以第一署名单位联合中山大学、江西省瑞昌长江四大家鱼原种场,首次完成并发布长江流域极危物种“鳤”高质量染色体水平基因组。
鳤曾是我国重要的淡水经济鱼类,广泛分布于长江流域,然而,由于环境恶化和人类活动的影响,数量急剧下降,在《中国脊椎动物红色名录》和《中国生物多样性红色名录—脊椎动物卷》中均被列为极危(CR),2020年12月在长江公安江段监测到了7尾鳤,是近年野外调查发现最多的一次,迫切需要对其开展保护。
鳤基因组信息的缺乏是保护工作的重大障碍之一,为进一步挖掘其种质资源特征,团队成员利用PacBio和Hi-C测序数据组装了鳤染色体级别的基因组,大小为883.1Mb,包含24条假染色体,ScaffoldN50长度为35.1Mb,配合转录组测序数据预测了28674个蛋白质编码基因,并已将组装和注释数据公布到GenBank和Figshare数据库。
论文共同通讯作者卢建国表示:“鳤基因组信息的首次发布对于理解遗传多样性、识别独特适应性以及制定有效的保护策略至关重要”。
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