中科院昆明植物所在广西火桐研究中取得新进展

身边24小时 2025-01-07 22:12:09

中科院昆明植物所科学家完成极小种群野生植物广西火桐高质量单倍型基因组的组装和基因功能注释,该研究为深度解析梧桐属植物的演化历史、广西火桐综合保护体系的建立和种质资源发掘利用奠定了基础。

广西火桐和高质量的单倍型参考基因组

据介绍,广西火桐是梧桐属落叶乔木,主要分布于中国南部石灰岩地区,因其鲜艳的橙红色花朵和独特的掌状叶具有较高的观赏价值。然而由于其有限的自然更新能力和自然栖息地碎片化,广西火桐正面临着灭绝风险。国际自然保护联盟(IUCN)将其列为极度濒危(CR),并被列入中国生物多样性红色名录,2021年被列为中国国家一级重点保护野生植物。

广西火桐地理分布范围狭窄,易受长期外部干扰,个体数量极低。野生种群不超过5000个成熟个体,每个孤立种群最多不超过500个成熟个体,保护的紧迫性显而易见。因此,国家林业和草原局在“十四五”国家极小种群野生植物拯救保护实施方案中,将广西火桐列为优先保护对象。

研究中,科学家首次获得火桐亚属首份高质量单倍型基因组。通过从头预测、转录本证据和同源蛋白证据共鉴定到67,527个蛋白编码基因,其中有92.33%的基因得到了功能注释。系列评估显示该组装无冗余、无塌缩、错误率较低且注释基因的完整度较好,具有较高的组装质量。该研究为深度解析梧桐属植物的演化历史、广西火桐综合保护体系的建立和种质资源发掘利用奠定了基础。

全媒体记者:张小燕

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