郑介民任国防部次长之后，对保密局局长这个兼职仍然不打算放弃，因而和副局长毛人凤的争斗很激烈，两人互不相让。 戴笠飞机失事身亡后，郑介民接掌军统局后又任国防部第二厅中将厅长，主管情报工作，军统局改为国防部保密局后，郑介民仍兼任保密局局长。之后郑介民又升任国防部次长，工作比过去更忙。蒋希望郑介民把工作的重心放些到争取美援与部队的补给方面，但是对于保密局这个重要的部门郑介民是不会轻易放手的。 毛人凤向来是以继承戴笠的"家业"来笼络军统分子的，他在保密局的潜在影响力是远远超过郑介民这个兼职局长的。郑介民、毛人凤两人拉拢特务们各有一套手法。毛人凤极力主张将保密局的规模恢复到戴笠军统时期那样，这对当时在保密局工作的百分之七十以上的特务训练班毕业的学生和长期从事特务工作又没有学历与资历的骨干分子来说，是有很大吸引力的。 郑介民则主张向外扩张，尽力鼓励学校毕业和有资历的特务向公开方面去发展和兼任公职。在郑介民的支持下，不少军统特务在一九四七年竞选国大代表和立法委员。各地竞选结果也算不错，保密局的特务们当上国大代表的竟有吉章简、马志超、马汉三、楼兆元、郑修元、柯建安、张家检、李广和、王抚洲、刘艺舟、王孔安、涂寿眉、罗毅、罗国熙、龚少侠、吴敬群、王兆槐、汪祖华、陈旭东、陈世贤、简朴等30多人。 军统特务王新衡在上海市竞选立法委员时，郑介民亲自去上海为其活动。王新衡和郑介民私交很好，他在军统中任处长多年，当时是上海的调查处处长兼顾问。王新衡竞选时，公开支持他的都是几个军统控制的外围团体，如上海的地方协会、社会安全促进会、青白体育会等一些微不足道的社团。这与吴国桢所推荐的上海地方士绅外交界元老之一的颜惠庆来比，无论在资历上还是在社会关系上都差得很远，但由于郑介民指使在上海的特务都要支持王新衡，结果王新衡所得的选票竟超过颜惠庆而成为第一名当选人。颜虽得吴国帧等全力支持，反而只当选为第三名。 虽然如此，但郑介民在保密局中所拉拢的只是少数大特务，在他领导的"广东派"中，一些留在保密局工作的人资历都很浅。郑介民把原来在军统局任过科长的张纪勋调升为办公室主任，等于主任秘书，当时的第一处处长何芝园和第二处处长叶翔之等人，在张纪勋还是科长的时候就已经是处长或副处长了，这些人自然不肯听张纪勋的话。加上毛人凤从中指使，处处故意让张纪勋为难，弄得张纪勋无法工作。最后郑介民不得不将张纪勋外调，而以其另一亲信黄天迈接任张纪勋的职务。 郑介民当了次长后，不再兼任第二厅厅长，毛人凤见时机来了，便集中全力来夺取局长一职。毛人凤得到蒋身边的亲信俞济时的全力支持，毛人凤指使人不断通过俞济时向蒋告郑介民，甚至连郑介民的老婆服用的珍珠粉向保密局报销的事都被蒋知道了。蒋大为生气，曾当面问郑介民："你老婆为什么要吃珍珠粉？"弄得郑介民狼狈不堪， 到最后，蒋叫郑介民辞去保密局长兼职，1948年初改由毛人风继任局长。郑介民这个光杆次长只是名义地位高，于是他又向蒋建议成立一个机械化兵团，这个想法并不现实，郑介民想当机械化兵团总司令的要求也被蒋拒绝了。
