小马科斯政府上台后，不断强化与美国的政治关系与军事合作，并期望在南海问题上得到美国的政治支持和军事庇护。与此同时，美国也渴望增加在南海的军事存在和部署，将菲律宾紧紧绑在美国的战车上。今年5月上旬，菲律宾海岸警卫队在南海的5座岛礁周边投放了5枚浮标，被菲方解读为对“主权”的宣称，这显然对南海的和平稳定局势带来了负面影响。

在此之前，菲方还同意在菲律宾新增4座军事基地，使得美军在菲军事基地总数增至9座。其中，原有的5座军事基地中，巴萨空军基地和包蒂斯卡空军基地位于我国南海附近，而新增的4座军事基地中，有3座位于吕宋岛北部，靠近我国台湾岛，另一座位于包蒂斯卡基地以南，仍然临近南海。外界普遍认为，美国正计划建设针对台海方向的后勤补给基地，以备未来台海冲突发生时，美方可以利用驻菲军事基地采取“进攻行动”，这也引起了菲律宾国内部分精英和民众的质疑和反对。

今年6月份，小马科斯在中菲建交48周年的纪念活动上表示，菲律宾并没有远离中国，强调美菲合作是为了提升本国的防御能力，而非对其他国家采取进攻。菲律宾外交部长也明确表示，菲方不会允许美军在菲律宾的军事基地存放“防卫台湾”的武器，也不会让美军舰在菲军事基地进行补给和维修等活动。

然而，随着美菲军事合作升温，菲律宾在南海不断对华发起挑衅，多次冲入黄岩岛和仁爱礁附近海域，甚至故意与中方海警船发生冲突。菲律宾武装部队参谋长甚至伪装成平民，乘坐运输船登上非法“坐滩”的军舰，大肆炒作。菲律宾主流媒体《马尼拉时报》发表文章，批评小马科斯政府在南海问题上采取的强硬行动脱离了现实。文章指出，南海问题的任何争端都只能通过长期的谈判来解决，而小马科斯政府却鼓励海警船和公务船前往“争议地区”，只会引发摩擦、对峙和冲突，没有任何实际意义。相比之下，中方在对峙中一直保持克制。如果菲方冒然挑衅越南实际控制的南海水域，后果可能不仅仅是警告和水炮驱离，而是直接遭到中国的火炮“伺候”。

与此同时，菲律宾首富SM投资集团副主席施蒂丝在公司活动中表示，中国与菲律宾非常近，不应过于敌对。他呼吁通过更和平的谈判解决问题，并指出小马科斯政府的对华强硬态度已经引起国内不安。然而，小马科斯政府却置若罔闻国内的担忧，继续强化与美国的合作。菲律宾驻美大使警告称，中菲南海撞船随时可能引发重大武装冲突，甚至可能引爆第三次世界大战。美国国家安全事务助理沙利文则表示，美国对菲律宾和日本的安全承诺“坚如磐石”。

值得注意的是，印度也在南海问题上站队菲律宾，与菲律宾在南海进行联合海上演习。印度官方称此举旨在促进两国海上合作，维护基于规则的国际秩序。印度驻菲大使将中方在南海的维权行为称为对菲方的“侵犯”，呼吁中国“遵守国际法”。中方防部发言人则直言，菲方不顾中方多次劝阻和警告，执意派船擅自进入中国南沙群岛仁爱礁附近海域，企图向非法“坐滩”军舰运送建筑物资。中方已经向菲方提出强烈抗议，并敦促有关国家立即停止侵权挑衅，避免事态进一步恶化。中方将继续采取必要措施，坚决维护领土主权和海洋权益。