是贮藏后期发生的最严重的生理病害，大多数苹果品种都易感染此病。其症状是发病部褐变，且呈不规则的微凹陷状，多发生在不着色的背阴面，严重时病斑连成大片如烫伤状，影响外观。苹果采收过早，成熟度较低是该病发生的主要原因。
防治方法:①易感病的品种应避免过早采摘。②采收后用二苯胺或虎皮灵处理果实。③果窖或果箱内的果实，勿使过度密集，防止贮藏后期温度升高。果品出窖时，要逐渐增温，避免由贮藏场所运往市场过程中温度骤升而引起发病。④降低氧的浓度，可进行气调贮藏。
2、苦痘病
果实采收期及贮藏期均可发生苦痘病。该病大都发生在皮下果肉组织内部，果皮向内凹陷，并呈灰褐色或绿褐色，病斑常呈圆形。苦痘病主要是由于果实含钙量较低总氮及蛋白质氮含量较高引起的，也与成熟期气温较高有关。因此最主要的防治措施是使苹果在生长发育前期吸收足够的钙，同时注意贮存果实的前期温度不宜过高，以免该病大发生。
3、衰老褐变病
根据其发病原因分为衰老褐变、低温褐变和二氧化碳伤害三大类。
（1）衰老褐变：是指果实后熟失常所引起的果肉变褐。由症状看，一种是果肉粉绵、变软，内部变成干而易碎的粉质状，后期变成褐色，果皮及外部果肉破裂。另一种是果肉褐变，果肉变为浅褐色，受病部分界限不明显，果肉不变粉绵且果皮不破裂。衰老褐变病是苹果过熟老化的一个象征，凡是促进苹果成熟的因素均可加速此病的发生。通过控制贮藏温湿度，采后用2%～4%的氯化钙液浸泡果实10分钟均可起到良好的防病作用。
（2）低温伤害：苹果贮温过低而引起的冻结也会降低果实硬度和缩短贮藏寿命。高浓度二氧化碳和高湿度都会加重低温伤害。低温伤害与低温和时间两个因素有关，短期低温并不引起伤害。现防治此病的有效方法是控制贮藏温度在2～4℃。
（3）二氧化碳和缺氧伤害：二氧化碳伤害分为果实外部伤害和内部伤害两种。外部伤害发生在贮藏前期，病变组织界限分明，呈黄褐色，下陷起皱。内部伤害果肉果心局部组织出现褪色小斑块，最后病变部分果肉失水成干褐色空腔，食之味苦，整果风味变淡，并伴有轻微发酵味，二者相同处是受害果硬度均不减。缺氧伤害主要是果皮木栓化，果肉至果心组织坏死，并有浓烈的发酵味。通过严密监测贮藏环境气体组分变化，如维持氧在2%～3%、二氧化碳在3%～5%，受害果乙醇含量在120毫克/100克以下，置于10～18℃的通风环境中，则大部分果实可复原。
