河南《创新科技》杂志社融媒体记者 房磊
近日,开封市农林科学研究院任丽研究员团队联合河南省农业科学院张新友院士团队在《Genomics》期刊发表研究论文。该研究完成了高油酸花生骨干亲本开选016的测序组装,旨在揭示其基因组信息。这一高质量的基因组组装为比较基因组研究提供了重要资源,促进高油酸花生基因组导向育种工作取得新进展。
高油酸花生骨干亲本开选016由开封市农林科学研究院于2003年培育而成,该材料被国内多家科研机构用于高油酸花生育种。截至2024年年底,由开选016衍生的高油酸花生品种258个,占国内高油酸花生品种的62.93%。开选016的创制及其衍生高油酸花生品种的育成为我国高油酸花生产业发展作出了积极贡献。 该项研究获批河南省重大科技专项、国家花生产业技术体系(CARS-13)、河南省良种攻关专项、开封市重点研发专项。
研究团队利用PacBio和Hi-C技术,完成了开选016基因组2532.9 Mb的组装,重复元素占基因组的72.26%,注释69845个蛋白编码基因。系统发育分析表明,A亚基因组和B亚基因组的分化时间分别约为0.3个百万年前和0.2个百万年前,其最初分化发生在约2.6百万年前。此外,研究还包括了物种特异基因的富集分析以及参与光合作用、亚油酸代谢和脂肪酸延伸等重要代谢和生物合成途径的基因家族的扩展、收缩和正选择,这些过程对发育种子过程中油酸的积累至关重要。另外,与变异来源材料AT1-1基因组的比较发现,物理诱变在开选016中产生了结构变异。 由于油酸的氧化稳定性强,并且富含油酸的膳食模式具有调节血脂作用,高油酸育种已成为花生新品种培育的一个重要方向,高油酸花生制品也越来越受到市场和消费者的青睐。
编辑:刘敏
审核:翟媛媛