《深潜》首播4集，故事从长沙第九战区作战参议曲文挚当叛徒讲起，他给日本人提供情报，试图暗杀第九战区司令薛岳，被共产党发现，及时阻止了，前后只有5秒的时间差，日本人差点干掉了薛岳。
同时曲文挚偷了长沙布防图，去了上海，要交给日本特工子爵。对此局座很生气，下令让军统湖南站站长柯靖平（刘欢饰）派人铲除叛徒。
于是在上海火车站上演了一场多方参与的、保护或暗杀曲文挚的行动。76号和日本特高课极力保护曲文挚，军统的人全部击杀曲文挚。现场还有两辆车，一辆车上是子爵，一辆车上是云弘深。
现场的布局都是通过云弘深的分析描述给观众的，这点其实有点上帝视角的感觉，再有子爵也在现场，而且安然无恙。在高位不仅有日本特工的狙击手还有国民党的狙击手，大家都没发现现场的两辆车？
云弘深（成毅饰）分析了火车站现场的局势，于是派人去干掉了日本的狙击手，同时打电话给76号，举报子爵的车。让日本人拦了子爵的座驾。
另一边云父云慕之（王劲松饰）和弗兰克正在把黄金兑成储备劵，云弘深出来阻止，对父亲有些误会。事实上，云慕之给日本人的并不是黄金，而是砖头。只是不知道他是如何做到的，毕竟全程都是日本宪兵在监督。
经过这一系列的操作，子爵对云家父子怀恨在心，试图杀之而后快。于是在云家举行的答谢酒会上，下毒加麻醉。可是子爵的这些算计，云慕之也非常清楚，于是将计就计，诈死。最后父子俩的配合下，除掉了子爵，拿到了一把重要的钥匙。这把钥匙可能是个伏笔，悬念吧。
可是日方的昆吾，也深知对手云慕之的狡诈，于是命令特高课严密监视云家，确认云慕之是否是诈死。虽然云家举行了丧事，可是云弘深却没有表现出悲伤的情绪，还去找了八哥。
云慕之诈死的局被识破，日方又设下圈套，利用八哥接头的由头，这次必定要杀父留子。果然云弘深上当了，他不听父亲的劝阻，逃跑了。于是云父只能以死赴局，救下云弘深。
这段剧情让人佩服的是徐管家，他在云慕之中弹的时候，也中弹了。但是他坚持把车平安开到家去倒下。就是不知道此时云弘深身边的两个助手到哪里去了？
曲文挚最终被闻夜鸣（颖儿饰）干掉，只是布防图并没在他身上。闻夜鸣和李亮完成任务后，坐货车离开上海返回湖南。
与此同时，云弘深为父亲举办了丧事，日军也抓住了做云弘深。只是半路上不知是哪波人救了云弘深，毕竟之前云慕之说过，他现在已经没有人手可用，有一个小组必须保持绝对的静默。并安排了他去法兰克银行取东西并寄出去。所以当时云慕之只得自己亲自出马，解救云弘深。
此后云弘深在火车站虚晃一下，回到家中拿了接头信物（半张照片）和骨灰盒，烧了云宅，去了湖南。
而在湖南的哥哥云弘祈，一直在施粥，救助被飞机轰炸后的难民。同时在家一直保护着奶奶，对奶奶很尊敬，家庭氛围很好。
得知父亲去世，他非常伤心，找到杨部长（何中华饰）确认，得知是假死，才稳定心神。但他一直瞒着奶奶。而后得知弟弟云弘深到了湖南，也是派人到处打听，看得出，他们虽然不是亲兄弟，却兄弟情深。
最后确认父亲真牺牲了，云弘祈（张天阳饰）发誓要为父亲报仇。从播出的4集剧情来看，张天阳这次好像饰演的是一个正面角色，而不是反派了。当初那个林谯松陪让人恨的牙痒痒，但又不得不佩服他的演技。
《深潜》作为一部谍战剧，期待值很高，只是从播出的4集剧情来看，似乎并不是特别理想。首先服装造型，有点偶像剧的感觉，太明艳了。其次，剧情的设定，有点神剧的影子，逻辑也不够严谨。
再者昆吾是谁？虽有伏笔，但这个人到底是谁？在上海还是湖南？按云慕之对他的了解程度，这个人应该在上海才对。可是接下来的故事背景在湖南啊。
