《罪恶的编年史》讲述了一位重案组刑警崔昌植在职业生涯的巅峰期，意外卷入一场错综复杂的阴谋，从而不得不面对自己内心深处最黑暗的秘密的故事。

崔昌植，一个在警界摸爬滚打多年的资深刑警，以其过人的智慧和勇气，一路升迁，成为了警队中备受瞩目的佼佼者。他即将升职，前途一片光明，家庭和睦，生活看似完美无缺。然而，正如古人所说，月盈则亏，水满则溢，在他最春风得意的时候，一场突如其来的意外打破了他平静的生活。

某夜，崔昌植与下属们聚餐庆祝自己即将升职的喜讯。酒足饭饱之后，他独自乘坐出租车回家。然而，出租车并没有将他送回家中，而是将他拉到了荒郊野外。司机突然变脸，对崔昌植展开了疯狂的攻击。原来，这位司机并非普通人，他似乎对崔昌植过去的罪行了如指掌。在一番激烈的搏斗后，崔昌植失手将司机杀死。这一刻，他的世界彻底崩塌。

为了掩盖罪行，崔昌植开始精心策划，伪造不在场证明，试图逃避法律的制裁。然而，他的阴谋并没有得逞。两天后，司机的尸体竟然出现在警局门前，而且接到了一个奇怪的自首电话。这个电话让崔昌植感到前所未有的恐慌和不安。他意识到，自己已经被一个隐藏在黑暗中的神秘人物盯上了。

在接下来的日子里，崔昌植不仅要面对警方的追捕，还要应对来自神秘对手的威胁。这个对手似乎对他的过去一清二楚，不断向他施加压力，逼迫他做出更多的妥协和让步。在调查过程中，崔昌植逐渐发现，这场阴谋背后隐藏着更加复杂的真相。原来，他的晋升并非完全凭借自己的能力和努力，而是有人在背后操纵一切。他的领导、同事，甚至是他最亲密的家人，都可能与他这次的危机有关。

在这个过程中，崔昌植不得不重新审视自己的人生和价值观。他开始意识到，自己一直以来所追求的权力和地位，其实都是建立在谎言和欺骗之上的。他开始反思自己的过去，试图找出自己陷入这场阴谋的根源。然而，每当他接近真相的时候，总会有新的阻碍出现，让他无法看清真相的全貌。

在影片的高潮部分，崔昌植与神秘对手展开了一场惊心动魄的较量。他们在一个废弃的仓库里展开了搏斗。这个仓库阴暗潮湿，充满了腐朽和死亡的气息。崔昌植和对手在仓库里你来我往，互不相让。每一次交锋都让人惊心动魄，紧张得让人屏息。在激烈的搏斗中，崔昌植终于揭开了对手的真面目。原来，这个对手正是他多年前一起处理过的一个案件的受害者家属。这个家庭因为崔昌植的错误判断而遭受了巨大的损失，他们一直在寻找机会报复。

在生死关头，崔昌植凭借过人的勇气和智慧，成功制服了对手。他紧紧地将对手按在地上，喘着粗气说道：“你以为你能打败我吗？你以为你能复仇吗？你错了！你只是在用自己的痛苦来折磨自己而已！”对手听到这句话后，眼中闪过一丝悔恨和无奈。他挣扎着想要站起来，但已经无济于事。最终，崔昌植将对手交给了警方，结束了这场惊心动魄的较量。

影片的结尾，崔昌植站在警察局门口，望着远方的天空。他感到自己仿佛经历了一场重生。他明白了人生的真正意义不在于权力和地位，而在于坦诚和勇气。他决定放下过去的包袱，重新开始自己的生活。他向警方自首，并主动配合调查，试图挽回一切。在警方的帮助下，他逐渐找到了证据，证明了自己的清白。同时，他也揭露了那些操纵他晋升、陷害他的人的真面目。最终，他得到了应有的惩罚和救赎。