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古代农民起义后，为何领头的不是想着推翻皇帝制，而是要自己当皇帝，可以从以下几个原因进行详细回答：

农民阶级的局限性：古代农民阶级的社会地位和经济地位较低，其思想观念、文化水平和政治意识相对落后。因此，在农民起义中，大多数农民领袖往往缺乏对国家政治制度的深刻理解，也没有受过系统的政治教育，他们对于推翻皇帝制这样的政治改革缺乏足够的认识和准备。

权力与利益的追求：在古代社会中，权力与利益紧密相连。成为皇帝，就意味着掌握了一个国家的最高权力，可以享有无限的荣誉和财富。因此，许多农民领袖在起义成功后，也希望通过成为皇帝来实现自己的权力与利益追求。

社会传统的影响：在古代社会中，皇帝制度已经存在了数千年，成为了社会传统和文化心理的重要组成部分。农民领袖在成为皇帝的过程中，也受到了社会传统的影响和制约。他们可能认为，推翻皇帝制会导致社会动荡和混乱，而成为皇帝则是维护社会稳定和秩序的有效手段。

古代农民起义后，农民领袖选择成为皇帝，是出于多种原因的综合作用。虽然这种选择可能存在一定的局限性，但也是符合当时社会现实和历史条件的必然结果。