施一公是知名的结构生物学家，他培养了许多优秀的学生。他的学生中，比较有名的有:
颜宁
1977年出生，1996年至2000年在清华生物科学与技术系获学士学位，随后前往美国普林斯顿大学分子生物学系学习，师从施一公教授，获博士学位。2023年11月1日，她宣布即将辞去普林斯顿大学教职，到深圳创立医学科学院，出任深圳医学科学院创始院长。
万蕊雪
90后，施一公团队的成员。
白蕊
90后，施一公团队的成员，曾获得2022年阿里巴巴达摩院青橙奖。
柴继杰
男，教授，博士生导师。1987年毕业于大连轻工业学院，1997年于中国科学院感光化学研究所获得博士学位。
闫创业
清华大学博士，师从施一公教授，曾获2019年度“清华大学特等奖学金”。
