麻省理工学院化学家采用生成式人工智能快速计算3D基因组结构

你不懂智能君 2025-02-02 15:26:40
🤖 由 文心大模型 生成的文章摘要

前文讲述了细胞内基因表达模

人体内的每个细胞都含有相同的基因序列,但每个细胞只表达这些基因的一个子集。这些细胞特异性的基因表达模式决定了脑细胞与皮肤细胞的不同,而这些模式部分取决于遗传物质的三维结构,它控制着每个基因的可及性。

麻省理工学院的化学家们现在想出了一种利用生成人工智能确定3D基因组结构的新方法。他们的技术可以在几分钟内预测数千种结构,比现有的分析结构的实验方法快得多。

利用这种技术,研究人员可以更容易研究基因组的三维组织如何影响单个细胞的基因表达模式和功能。

化学副教授、这项研究的资深作者张斌表示:“我们的目标是尝试根据底层DNA序列预测三维基因组结构,现在我们可以做到这一点,这使得这项技术与尖端实验技术相媲美,它确实可以开辟许多有趣的机会。”

在细胞核内,DNA和蛋白质形成一种称为染色质的复合体,染色质具有多个组织层次,使细胞能够将2米长的DNA塞进直径仅为百分之一毫米的细胞核中。长链DNA缠绕在称为组蛋白的蛋白质上,形成一种类似于串珠的结构。

被称为表观遗传修饰的化学标记可以附着在DNA的特定位置,这些标记因细胞类型而异,会影响染色质的折叠和附近基因的可及性。染色质构象的这些差异有助于确定哪些基因在不同细胞类型中表达,或在特定细胞的不同时间表达。

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