建炎四年（1130年）的福建很不太平。

建炎元年，金兵分三路大举南下，三年里侵占大片宋土。建炎三年十二月至次年夏天，一支金兵从江西突入福建邵武，烧杀抢掠，大宋军民奋起抵抗，金兵方才北退。

外忧未平，内患又起。五月初，浙中龚仪的叛兵从龙泉破隘入闽，破松溪，下建州，急攻南剑。八月，以私盐贩为首的武装力量推举范汝为起义，聚众数千，出没于建宁、南剑一带。同时，邵武光泽县有刘时举起义，拥众万人。南剑顺昌县有余胜起义，聚兵数千。一时间，闽中“食日益阙，兵日益众，盗日益多，民日益困”。（《高峰文集》卷一）

为了躲避兵燹，此前赋闲五年的小吏朱松不顾刚刚在建州权职，慌忙弃官，携家眷一路逃难，先到政和，后至尤溪。朱松曾任尤溪尉，郑安道之子郑德与时任尤溪宰，两人结为知交，此赴尤溪，朱松一家便寓居郑氏馆舍之中。

九月十五日午时，朱松的妻子小五娘祝氏在郑氏馆舍为他诞下第三个儿子。尤溪古称沋溪，朱松便给这个出生于犹溪河畔的季子取小名为“沋郎”，小字季延，以排行又叫五十二郎。据学者考证，后来人们一直以为朱熹小名“沈郎”，实际是字误传讹。

朱松立刻给在故里婺源的丈人去信一封，详细告知沋郎出生时的情况：

小五娘九月十五日午时娩娠，生男子，幸皆安乐。自去年十二月初在建州权职官，闻有虏骑自江西入邵武者，遂弃所摄，携家上政和，寓垄寺。五月初间，龚仪叛兵烧处州，入龙泉，买舟仓皇携家下南剑，入尤溪，而某自以单车下福唐见程帅。在福唐闻贼兵破松溪隘，骎骎东下，已入建州，攻南剑甚急，又匆匆自间道还尤溪。六月十四日早到县，而贼兵已在十数里外矣。幸二舍弟已搬家深遁，是日即刻与县官同走至家间所遁处……七月间方还县，而瓯宁土寇范汝为者，出没建剑之间，其众数千，官军遇之辄溃，诸司不免请官招安，已还状，收犒设将，散其众。无何，大兵自会稽来，必欲进讨，昨日方报，大兵冒昧入贼巢，丧失数千人，贼势又震。大略自今夏以来，未尝有一枕之安。（《朱文公文集续集》卷八《韦斋与祝公书跋》）

传说朱熹出生有诸多祥瑞之兆。比如他出生前三天，远在千里之外的婺源南街朱氏故宅的古井忽然紫气如虹，似乎预告着“紫阳先生”降临人间。另据民国《尤溪县志》记载，九月十四日傍晚，尤溪县城关南向公山与北向文山同时起火，火势呈现“文”“公”二字。朱松见状感叹道：“天降祥瑞，必有所应，此‘喜火’祥兆也！”第二天朱熹便出生了。朱松以文公二山的奇火，为小儿取名“熹”，乃“喜火”二字的结合。尤溪人尊重朱熹，又有文公二山喜火的吉兆，便尊称朱熹为“朱文公”。

刚出生的朱熹右眼角旁有七颗黑痣，排列成北斗七星的样子。据传孔子也是一生下来身上就长有奇异的黑痣。这似乎也印证了一位隐士曾对朱松说过的预言：“富也只如此，贵也只如此。生个小孩儿，便是孔夫子。”（《尧山堂外记》卷六《朱熹》）

按照当地风俗，九月十七日举行三朝洗儿会，亲朋登门庆贺，对月吃汤饼，刚出生的朱熹被放在四周绕着洗儿果彩钱的香汤盆中沐浴，盆中漂着果子、彩钱、葱蒜。围观的亲友争着把钱撒在汤水里，称为“添盆”，生子心切的妇女们抢着盆汤中直立的枣子吃，希望早生贵子。

郑氏馆舍之主郑安道作了两首贺诗：

今宵汤饼会，满座桂香米。圆月飞金镜，流霞泛玉杯。渥洼无异种，丹穴岂凡胎。载路声闻彻，祥光烛上台。

瑞气蔼南山，弧悬别墅间。此时歌降岳，他日见探环。席敞篱花艳，尊浮竹叶斑。老父歌既醉，拄杖月中还。

（《南溪书院志》卷四《朱乔年尉公举男往贺留赋二诗为赠》）

然而朱松的洗儿诗二首却显得颇为伤感：

洗儿二首

行年已合识头颅，旧学屠龙意转疏。

有子添丁助征戍，肯令辛苦更冠儒？

举子三朝寿一壶，百年歌好笑掀须。

厌兵已识天公意，不忍回头更指渠。

（《韦斋集》卷六）

朱熹家曾是名门望族，出自三国时东南四大著姓之一的吴郡朱氏，世代业儒。不过到朱熹祖父一代，已然家道中落，他自己只是个酸腐士子，未曾入仕。朱松从小苦读经书，自觉满腹经纶、胸藏治国安邦之策，如今才体悟到这些不过是无用的“屠龙之技”。在这个乱世，儿子长成能够为国作战的士兵就可以了，何必要辛辛苦苦学儒？

生活困顿和颠沛流离一直贯穿着朱熹的童年。范汝为、刘时举、余胜起义军来来回回，建剑一带动荡不定，襁褓中的朱熹跟着家人四处遁逃寄寓。绍兴元年（1131年）二月，一家人从尤溪逃往古田龙爬，接着秋间又逃到长溪，寓居在龟灵寺。次年春，朱松又携全家逃奔福州，渡鸡屿洋，躲居在桐江。这一年，南宋朝廷终于派出大军剿灭起义军，朱松才又携全家重归尤溪。此时的朱熹已经三岁了。

生活环境安定下来，朱松的仕途也有了起色。他受到了知枢密院事赵鼎赏识，准备任用朱松为幕属。谁料此时朱松母程氏卒，朱松丁忧归尤溪，再次失掉了升官的良机。

丁忧期间，朱熹的两个哥哥相继去世，给了朱松很大打击。生活上，一家人又陷入了“尽室饥寒”的境遇。朱松只好把所有希望都寄托在仅存的这个儿子身上，亲自给他启蒙上课。

望子心切的朱松在绍兴四年（1134年）就把朱熹送进了小学，他写信告诉内弟程复亨说：“息妇生男名五二，今五岁，上学矣。”（《朱熹年谱》）他在送子入学写的一首诗中，对这个年仅五岁的儿子提出了严苛的要求：

送五二郎读书诗

尔去事斋居，操持好在初。

故乡无厚业，旧箧有残书。

夜寝灯迟灭，晨兴发蚤梳。

诗囊应令满，酒盏固宜疏。

貘羁宁似犬，龙化本由鱼。

鼎荐缘中实，钟鸣应体虚。

洞洞春天发，悠悠白日除。

成家全赖汝，逝此莫踌躇。

（《重刊韦斋集》卷四）

朱熹不负父望，颖悟早慧，很快就崭露头角。刚开始诵读孝经，朱熹就能明白大概意思，并在书上写下了八个字：“若不如此，便不成人。”（《宋名臣言行录外集》卷十二）

五岁时，朱松指着天教他说“天也”，朱熹竟发问：“天之上何物？”这使朱松大为惊奇。（《朱熹行状》）此时的朱熹第一次有了烦恼：天地四边之外，是什么事物？大人告诉他四方无边，可是朱熹思量任何事物也须有个尽处，就像墙壁一样，墙壁之后一定有别的东西。他为此陷入了深深的思考，几乎成病。

六岁时，朱熹和一群小孩在南溪书院前玩沙子，他端端正正地独坐一旁，用手指在沙子上画画，大人一看，他画的是八卦，纷纷称赞他为神童。后来人们便把尤溪水岭西岸的沙洲称为画卦洲，连建瓯也附会这件事建了一座画卦亭。

在这个阶段，朱熹开始学习四书，他很下功夫，“甚辛苦”，读过《论语》《孟子》，想找一本水平跟二者接近的书，竟然一本都找不到了。

朱熹在尤溪的童年生活随着朱松守丧服除而结束。绍兴七年（1137年）夏，朱松被召入对，赴都之前，他把祝氏和沋郎送到建州浦城寓居。

在尤溪时期的朱熹性格内向，沉默孤独，却老成持重，才思初现，“圣人”之象初见端倪。相传朱松和朱熹在郑氏馆舍种下两棵樟树，从高处看，周围的山脉好似缺最后一点的“公”字，而这两棵樟树恰好把这一点补上了。这似乎预示着，泽被后世的“朱文公”即将从尤溪走向更大的舞台。