如果通天教主及早发现元始天尊的所谓“阴谋”并带领截教反抗，截教或许有可能改变覆灭的结局，但也只是存在一定概率的可能，以下是一些相关的分析：

有可能改变结局的因素

从内部方面

战略调整：

可以提前收缩战线，将众多分散的截教门徒聚集，避免被阐教各个击破，集中力量防守重要据点和洞府。

对一些可能被阐教利用来挑起矛盾的事件和人物提前管控，比如约束像申公豹这样的在截教中活跃但立场不明的人物，减少内部矛盾被外部利用的机会。

加强思想统一：

让截教众人充分认识到危机，而不是如之前那样部分人还对阐教抱有幻想（认为三教一家），可以凝聚人心，增强内部的团结和战斗力。

战术准备：

利用截教人数众多和一些特殊法宝、阵法优势，提前布置针对阐教的陷阱，比如在一些关键路径和战场预设厉害的阵法等。

加强对核心弟子的保护和培养，避免过早折损一些重要高手。

从外部方面

外交手段：

通天教主可以积极与大师兄老子沟通，阐明元始天尊的做法对整个鸿钧道统的伤害，争取老子的中立或者有限支持，老子在封神大战中多次帮助元始天尊，如果老子态度改变，局势将大不一样。

与西方教进行一定程度的利益交换或达成某种默契，让其不参与到与截教的冲突中来，甚至有可能反过来制衡阐教，毕竟西方教也是想在封神中谋取利益的。

与人间势力如纣王等达成一定协议，在人间战场方面给予截教支持，或者利用人间势力牵制阐教在人间的布局。

舆论方面：

向三界广泛宣传阐教的“不义之举”，从舆论上让阐教处于不利地位，让一些中立的神仙势力和散仙对阐教产生不好的看法，从而在一定程度上孤立阐教。

不太可能改变结局的因素

自身限制方面

教义矛盾：截教教义“有教无类”导致其门徒众多但良莠不齐，难以在短时间内改变这一本质问题，在长期对抗中依然会因为部分不良门徒的行为而被外界抓住把柄，被针对打击。

实力对比：虽然截教号称万仙来朝，但元始天尊一方有老子、接引、准提等多位圣人，如果这几位联合起来，通天教主即使提前准备，也很难在圣人层面的对抗中取得优势。

外部不可抗力方面

封神榜的既定规则：封神榜的存在是为了满足天庭的需求，即使通天教主反抗，如果依然在这个大规则体系下，截教众多门徒的命运其实也很难完全自主，总会有相当一部分要被卷入封神中。

天意难违：在《封神演义》的设定中，天意是一个非常重要的推动因素，而似乎天意就是要推动封神大战以及截教的衰落，这种冥冥之中的力量可能会以各种方式阻碍通天教主的反抗努力，比如通过一些意外事件让其计划破产等。

所以综合来看，如果通天教主提前发现并反抗，会给截教带来一定转机，但鉴于各种复杂因素交织，很难说一定能使截教完全幸免于覆灭的结局，只能说结局会有很大的不确定性和变数。