同等学力申硕只颁发硕士学位证而不发毕业证的原因主要是其教育性质属于非学历教育。具体来说：
1、非学历教育性质：同等学力申硕是根据《中华人民共和国学位条例》及其实施办法，为具有研究生毕业同等学力的人员提供的一种学位教育形式。这种教育形式侧重于学术水平的评价和学位的授予，而不涉及学历的变更。
2、学位与学历的区别：学位是标志被授予者的受教育程度和学术水平达到规定标准的学术称号，而学历则是指人们在教育机构中接受科学文化教育和技能训练的学习经历。同等学力申硕主要关注的是学术水平的提升和学位的获得，而非学习经历的认证。
3、教育目标与定位：同等学力申硕的目标是为那些已经具备研究生毕业同等学力但未能获得相应学位的人员提供一个获得学位的途径。其定位在于满足特定人群对学术水平提升的需求，而非提供全面的学历教育。
因此，同等学力申硕在完成学业并达到学位授予条件后，只会颁发硕士学位证书以证明其学术水平，而不会颁发毕业证书来认证其学习经历。这种制度设计既符合我国学位与学历管理的相关规定，也满足了特定人群对学术水平提升的需求。
