理科二本的录取分数总体上比较正常，但随着这几年大家对专业越来越重视，公办二本大学中，录取位次低于民办公办分界线（85000左右）的学校还是有不少，主要是一些偏远地区的地级市院校。比如昌吉学院、梧州学院、喀什大学、塔里木大学、红河学院、萍乡学院、闽江学院等。
除了上述院校外，还有几所实力不错的大学录取分数出现了大幅波动，比如哈尔滨师范大学、内蒙古师范大学。其中内蒙古师范大学的最低录取位次为126000多，已经离二本线不远了，这确实不正常，但这所学校出现这种情况是有原因的，该校的招生计划为13人，实际投档人数为23人，增加了10人，这是造成分数大幅下降的最主要原因。
二本理科录取分数比较高的院校主要是医学类院校，比如徐州医科大学、贵州医科大学、温州医科大学、安徽医科大学、新乡医学院等。因为这些大学的实力比有些一本的医学院还要强，而且在本省都是一本招生，录取分数高也属于正常。但要上这些大学，分数也要比一本线高几十分。
除了医学类院校外，二本中也有不少实力不错的大学可供选择，比如沈阳航空航天大学、南昌航空大学、天津科技大学、苏州科技大学、山东理工大学、青岛理工大学、西北师范大学、广西师范大学、河南师范大学、浙江财经大学、成都理工大学等。
如果一本院校中没有比较满意的大学可选，选择一所在二本招生的外地院校也是一个不错的选择。
下面是二本理科院校近三年的最低录取分数及位次。
