进口二手机械设备通关是一个复杂而细致的过程，需要企业充分准备并遵循一系列严格的规定和流程。

一、进口二手机械设备前期准备工作

在进口二手机械设备之前，企业需要做好充分的准备工作。首先，要明确设备的具体信息，包括设备的名称、型号、规格、数量、生产厂家、制造年份、产地以及使用目的等。企业还需准备相应的合同、INVOICE、装箱单等单证资料，并确保这些资料的真实性和准确性。

不同国家和地区的进口政策和相关法规不尽相同，企业在进口前需要充分了解目标国家的进口政策和相关法规，确保设备符合进口要求。部分二手机械设备可能需要办理特殊监管手续，如3C认证、进口许可证等。

二、进口二手机械设备装运前检验检疫

对于列入《进口旧机电产品检验监管措施清单》中的二手机械设备，应在起运地或中转地实施装运前检验，并取得装运前检验证书后方可起运。装运前检验的目的是确保设备在运输过程中不会因质量问题而对人身安全、动植物生命和健康、环境保护等造成威胁。

在装运前检验过程中，检验机构会对设备的外观、性能、安全装置等方面进行详细检查，并出具相应的检验报告。企业需要取得《进口旧机电产品装运前检验证书》等检验证书，这些证书是后续报关和清关过程中需要提交的重要文件。

三、进口二手机械设备起运及到达目的港

进口二手机械设备起运前，企业需要在国外起运港办理出口手续，包括出口拖车、订舱、报关、吊柜装船等。这些手续需要按照国外当地的相关规定和要求进行。当设备到达目的港后，企业需要向提交报关单、合同、INVOICE、装箱单等单证资料，并缴纳相应的关税和增值税。

会对进口二手机械设备资料进行审核，并根据设备的实际情况进行查验。查验方式包括现场查验和实验室检测，主要检查设备的外观、数量、型号等信息是否与单证相符，以及设备是否存在质量问题。

四、进口二手机械设备报关及清关流程

报关及清关流程是进口二手机械设备通关的关键环节。企业需要向提交完整的报关单证资料，包括进口报关单、合同、INVOICE、装箱单、装运前检验证书等。

根据要求，企业需要缴纳关税和增值税。关税的计算公式为：进口关税税额=完税价格（合同的到岸价）×关税税率。增值税的计算方法：完税价格=（到岸价格+关税）/（1税率）。

进口二手机械设备报关过程中，如果设备需要办理3C认证、进口许可证等特殊监管手续，企业需要在报关前或报关过程中及时办理这些手续。

五、进口二手机械设备查验及商检监管

进口二手机械设备进行查验。查验合格后，货物会转到商检监管区进行检验检疫。商检人员会对设备进行详细的检验检疫工作，并出具检验检疫报告。如果设备检验合格，企业需要缴清关码头费用，并办理提货手续；如果设备检验不合格，则不予进口。