在此轮军改中，武警部队的干休所、武警天安门国旗护卫队、武警礼炮中队、武警部队总医院、部分武警院校先后转隶解放军下属各单位。例如，武警部队的干休所按照属地分别移交给相应的省军区或直辖市警备区，而原武警政治学院则被并入了国防大学，原武警天安门国旗护卫队、原武警礼炮中队转隶解放军仪仗司礼大队，还有武警总医院则是转隶联勤保障部队下属的解放军总医院并改编为后者的第三医学中心。

不过，有出必有进，武警部队虽然有部分力量移交给了解放军，但解放军同样有一部分力量转隶到了武警部队，那就是军事监狱和军事看守所。

军改前，原先的七大军区都各自管理着一个军事监狱（领导机关是军区政治部），而省军区/直辖市警备区也会分别设立一个军事看守所。军事监狱、军事看守所在职能作用方面和地方上的司法监狱、公安看守所类似，但其看押的人员都是军队现役人员或者是涉及军事机密的涉案人员等；且军事监狱、军事看守所的管理人员都是解放军现役军人，而非警察。

而军改后，原先的七大军区被撤销，转而成立五大战区作为某一战略方向的唯一最高联合作战指挥机构，军委给战区的定位是“战区主战”。在此背景下，战区要专心从事指挥联合作战、国防态势分析的任务，也不负责领导管理部队，那么再领导管理军事监狱就不合适了。于是，原先七大军区下辖的军事监狱被合并为目前的5所，每个战区各配置一所，且全部移交给武警部队管理了，分别是：武警部队第一军事监狱（驻东部战区）、武警部队第二军事监狱（驻南部战区）、武警部队第三军事监狱（驻西部战区）、武警部队第四军事监狱（驻北部战区）和武警部队第五军事监狱（驻中部战区）。

与之类似的，军改中，省军区系统也发生了很大变化：如新疆军区、西藏军区、北京卫戍区转隶陆军，成为陆军的组成部分，以部队管理建设、防卫作战为主业。而其余28个省军区、直辖市警备区则是转隶军委国防动员部，成为国防动员单位，以国防动员、后备力量建设、兵役征集、民兵队伍管理建设、军地协调联系等为主业。

也就是说，省军区系统的任务重心更为明确、更为精简。在此情况下，原先由省军区、直辖市警备区领导管理的军事看守所统一转隶至武警部队，并由武警各省/市/区武警内卫总队具体管理。军事看守所转隶武警部队后，同时进行了更名，标准命名格式是“武警部队+省级行政区——军事看守所”，如武警部队吉林省军事看守所、武警部队海南省军事看守所、武警部队广东省军事看守所、武警部队山东省军事看守所、武警部队西藏军事看守所等等。

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