1945年抗战胜利后，蒋介石假惺惺的给毛主席发来一份电报，邀请主席到重庆参加民主谈判。毛主席对蒋介石此举很不理解，毕竟老蒋向来反复无常，如果自己贸然前去，万一要是出了意外，后果不堪设想；可如果毛主席拒绝接受蒋介石的邀请，老蒋必定会给中共扣上一顶“破坏统战”的“帽子”，并趁势挑起内战。

万幸的是，就在毛主席举棋不定的时候，李克农将军通过无线电侦测手段，截获了一封国民党中央政府的电报，其中明确表示，蒋介石邀请毛主席谈判只是虚张声势，老蒋碍于国内舆论和国际观瞻，也不敢对毛主席下毒手。李将军连忙将这个消息告知给毛主席，于是主席便决定顶着压力去一趟重庆，会一会蒋介石这个手段狠辣的“独裁者”。

蒋介石明显没想到主席竟然敢“单刀赴会”，一时竟有些慌乱，他连忙指派相关部门迎接毛主席，并匆匆敲定了谈判地点和谈判流程，装模作样的和毛主席商讨建立“联合政府”一事。经过一番唇枪舌剑的交锋，国共双方就一些基本问题达成一致，并签订了合作协定。但这仅仅只是蒋介石的“缓兵之计”，仅仅1年之后，老蒋便突然撕下伪善的面孔，集结军队进攻我方的革命根据地，解放战争由此打响。

1947年，蒋介石命令胡宗南率领三十万大军进犯延安，毛主席一开始想调集西北野战军以及晋西北解放区的部队，在黄土高原上摆开阵势，和国民党军硬碰硬打上一仗，以保卫延安根据地，守住红色阵营的“心脏”。但陈赓将军却认为，耗费如此庞大的人力、物力死守延安根本不划算，不如主动撤退，将延安让给胡宗南。

毛主席最终采纳了陈赓的建议，随即率领党中央所有机关单位，在警卫部队的掩护下，撤离延安，北上进入榆林。胡宗南自然不肯轻易放弃，马上率部追赶上来，死死咬住党中央。在此期间，李克农一直尽心尽力的保护着毛主席和周总理，没有让这两位中央领导人受到一丁点伤害。

1948年，党中央渡过黄河，横穿山西和豫北，最终顺利抵达西柏坡，并就此驻扎下来，重新恢复了日常工作。毛主席和周总理随后亲自指挥了“三大战役”，一举消灭了国民党军主力，接连解放了东北、华北、华东。1949年初，李克农奉命进驻北平城，他协助公安部门和政保部门清除了潜伏的特务，消除了社会不安定因素，随后亲自迎接党中央进驻北平城。建国后，李克农带病参加了中国、美国之间有关朝鲜战争的谈判，最终促成双方签订停战协定，绵延了三年的朝鲜战争就此结束，西方资本主义入侵朝鲜的阴谋随即宣告破裂。

1955年大授衔期间，中央军委原本打算授予李克农中将军衔，可毛主席认为，李将军是情报战线上一位不可多得的人才，他曾经救过自己和周总理的命，为革命做出了不可磨灭的贡献，仅仅只授予中将实在不妥。于是中央军委便将李克农列入上将名单，并特地授予他两枚荣誉勋章，以示鼓励和褒奖。

1957年，李克农将军不慎摔倒，并因此引发了脑血管疾病，被迫入院接受治疗。1958年，他的身体状况稍稍好转，又重新回到岗位上继续工作。1961年，李克农的妻子不幸病逝，他因此大受打击，继而旧病复发，再度离职休养。1962年，他突发重疾，最终因抢救无效去世，时年六十三岁。

李克农有五个子女，其中次子李力毕业于军校，曾长期在总参部任职，80年代中旬，他退出现役，转入电力部门工作，一度官至副省部级，新世纪初，他离开工作岗位，至今仍健在；李克农的小儿子李伦毕业于延安自然科学院，解放战争时，他曾在华野服役，参加过豫东、淮海战役，立下了不少战功。建国后，他被调入总后勤部任职，并于1988年被中央军委授予中将军衔。1989年，他升任总后勤部副部长，主管科研与文教工作，1993年，他因为身体原因主动申请离退，2019年，他因为心脏病发作离世，时年九十一岁。

李克农的小女儿李冰是一位杰出的医务工作者，她致力于研究肿瘤和癌症，先后治愈过无数重病患者，堪称“华佗在世”，1988年，她因病离开工作岗位，2002年病逝。