2000年3月，时任湖北省监利县棋盘乡党委书记的李昌平，上书国务院总理，发出了“农民真苦、农村真穷、农业真危险”的声音。

支撑李昌平发出这种声音的勇气，在于当时的农村与城市发展相比，确实在走回头路。整个90年代，农村改革停滞不前，而城市改革的成本，却要转嫁到农民头上。1990年到2000年的10年间，农民税费负担总额从469亿元增长到1359亿元，人均负担增长了3倍，税费负担已占农民收入的30%以上。“十顶大盖帽对着一顶破草帽”的顺口溜也在各地广泛流传，减轻农民负担的呼声也在不断增多。

改革过于向城市倾斜，忽视农村改革的问题，不仅表现在操作层面上，在决策层面同样非常明显。从1982年到1986年中央连续下发了5个事关“三农”的“一号文件”后，到了90年代，“一号文件”再没提到“三农”问题。直到2004年，“一号文件”才重新回到“三农”上来。

而从1997年至2003年的六年时间里，城乡居民收入比也由2.47扩大到3.23，粮食产量则由1998年的10246亿斤，锐减到2003年的8614亿斤，粮食安全形势日益严峻，城乡矛盾、工农矛盾也在加剧。如果城乡差距继续拉大，将对整个社会的稳定都产生极为不利的影响。因此，2004年的中央“一号文件”，聚焦的就是“农民增收”问题。此后的二十年，中央“一号文件”再也没有离开过“三农”。

中国的改革首先从农村开始，此后的十多年时间，农村改革却停滞不前，显然是不利于改革作用的有效发挥的。因此，十八大以来，在改革问题上，一直强调全面深化改革，就是为了防止改革再出现城乡不协调、地区不统一现象，最大限度地提高改革的作用与效率。