2003年3月20日，美英联军在没有联合国授权的情况下，借以萨达姆拥有大规模杀伤性武器为由，发动了伊拉克战争。很快，美军就攻占了巴格达，萨达姆被迫逃亡。然而，由于亲信出卖，萨达姆在逃亡8个月后，在家乡被美军抓捕，关押在美军设在巴格达的监狱里。

2004年6月30日，美军将萨达姆移交给伊拉克临时政府，同一天，伊拉克临时政府正式宣布逮捕萨达姆，从这一天起，萨达姆的身份不再是战俘，他将接受伊拉克临时政府设立的特别法庭的审判，特别法庭指控萨达姆犯下了14项罪行，这些罪行包括为排除异己搞的打击报复，入侵科威特，搞政治暗杀等，特别法庭给萨达姆定的罪名是反人类罪。

在萨达姆接受审判之时，作为中东双雄之一的卡扎菲说了这样一句话：“萨达姆是联合国一个成员国的首脑，伊拉克战争打响后他是一名战俘，应该对处死萨达姆事件进行调查。”随后在召开的阿拉伯峰会上，卡扎菲公然表示，阿拉伯联盟在保护萨达姆的利益上做得不够。卡扎菲在愤然退出会场之前说：“有两个阿拉伯国家的元首被困在监狱里，还怎么开这个峰会呀？”卡扎菲所说的第二个被困的阿拉伯元首是指阿拉法特。

而性格强硬、想法酷似父亲的卡扎菲的女儿阿伊莎，也加入了萨达姆的辩护律师团，为这位饱受争议的伊拉克前总统辩护，她表示：“我认为有责任为受到错误指控的人辩护。”她领导的一个慈善组织也发表声明说：希望确保萨达姆受到公正的审判，也就是说，和所有被告一样，在被证明有罪之前，萨达姆应该被假定是清白的。不仅如此，阿伊莎还对萨达姆的辩护律师团提供物质和财政方面的援助。对于女儿这样的做法，利比亚领导人卡扎菲十分支持。