事业单位按照经费来源可以分为三类，分别是一类事业单位，经费由财政全额保障，二类事业单位，经费由财政部分保障，不足的部分由单位自行解决，三类事业单位，经费由单位自行解决，管理基本上都是参照企业模式，一类事业单位和二类事业单位的区别主要体现在工作稳定性、职业发展两个方面。

在工作稳定性方面，一类事业单位要比二类事业单位更加稳定，退休待遇也更加有保障。

一般来说，一类事业单位在职干部的工资、奖金都由地方财政保障，不受地方经济的波动，干部的工资、奖金都会定时足额发放，而且干部在退休以后，个人的实际收入也不会有太大的变化，即使是遇到事业单位改革等问题，政府也会将其安排到其他的全额拨款事业单位，不会有任何失业的可能性，而对于二类事业单位来说，财政更多的时候只保障其基本工资，奖金都是由单位自行解决，这个时候就要看单位自身的营收能力，而且在退休以后，能拿到多少养老金也和单位缴纳的保险有直接的关系，同时，二类事业单位改革的时候，内部职工只能根据其性质进行分流，大部分都是等待单位改革完成以后，继续在原单位改制后的新单位工作，这其中有着很大的风险。

在职业发展方面，一类事业单位干部职工有着比二类事业单位职工更多的选择，而且干部可以从一类事业单位流动到二类事业单位工作。

对于体制内的工作者来说，除了工资待遇以外，最关心的莫过于个人的前途，一般来说，一类事业单位大多都是综合管理类事业单位，在此类单位工作的干部，在条件允许的时候，可以在本单位提拔为领导岗位，也可以交流到类似的一类事业单位担任领导，二类事业单位的专业化非常高，内部的干部在开始的时候，就只能在单位内部发展，如果单位内部没有空缺的职数，这个时候就只能等待，没有更好的方法，想要调入其他二类事业单位基本不可能，因为业务方向不同，同时，在一类事业单位工作的办事员，可以调入二类事业单位工作，在进行调动的时候，还会适当的提升其职务，而二类事业单位干部职工则没有这样的机会。

然而，一类事业单位与二类事业单位之间并没有绝对的优劣，主要还是看二类事业单位的具体情况。

比如在常见的二类事业单位当中，医院就是比较典型的代表，医院的在编干部并不会比政府所属的事业单位差，甚至在很多时候，医院的医生在待遇方面要比政府所属事业单位更好。当然，有好就有差，比如二类事业单位当中的设计院，如果接不到足够的业务，那么干部的总收入就会远低于一类事业单位，同时，无论是一类事业单位还是二类事业单位，只要担任单位的一把手，这个时候单位的性质对于个人的影响已经不大了，同样以设计院为例，院长可以毫无障碍的交流到其他一类事业单位担任领导职务，甚至交流到行政机关担任领导。