黄埔五期生到了1938年，能担任中央军上校团长，其实并不稀奇，但是1939年底爆发的桂南会战，确实给郑庭笈提供了一个机会：荣誉第1师血战昆仑关，前仆后继伤亡惨重。

时任荣1师团长的郑庭笈，因此以其悍勇，颇得第五军军长杜聿明、荣1师师长郑洞国的欣赏，不久提拔为军主力第200师的少将步兵指挥官，兼师属第598团团长，又成为戴安澜的部下。

1942年郑庭笈跟随海鸥将军，率部踏出国门参加远征，第200师曾在同古大破日寇，后因整体战局不利，被迫撤退回国。一路上遭遇恶劣环境和日寇袭击，第200师损失惨重，戴安澜也身负重伤。

在师长重伤，参谋长和另外二名团长或死或失踪的情况下，郑庭笈当仁不让地站出来，率全师官兵抬着师长，历尽艰辛返回祖国，到达云南境内时只余2600余人，第200师损失高达75%！基本残了。

不过郑庭笈的表现，仍然得到高层肯定，遂调往重庆受训并授勋，毕业后重回杜聿明手下任职，正式升任第五集团军直辖的第48师少将师长，这个师是以第五军残余的装甲兵，补充坦克汽车组建起来的。

第48师时辖一个战车团、一个摩托化搜索团和二个步兵团，属于一个不太合格的“机械化师”，隶属于第五集团军总司令、昆明防守总司令杜聿明直接指挥，说明郑庭笈还是被升职并重用了，该师抗战胜利前夕撤编。

郑庭笈那是“文昌三郑”的老小，加上有战功，所以继续重用，先调陆军大学进修，结业即被任命为新编第六军副军长兼师长，再成为廖耀湘的副手，继续在杜聿明的手下做事，俨然成为“五军系”的骨干人物。

到1948年春，郑庭笈再晋第49军中将代理军长，也标志着南京要将这支东北军余脉，彻底“中央化”的意思。其堂兄郑庭锋则在华北，担任嫡系第94军的军长，哥俩都成为手握重兵的将领，上面还有郑介民罩着。

岂料好景不长，辽沈战役打响后，郑庭笈第49军被编入廖耀湘的西进兵团，在辽西围歼战中兵败被俘。