1993年的时候，李连杰和香港大佬向华强的永盛电影公司签下了一年拍摄六部戏的合约，李连杰拍戏的时候，由于档期紧张，白天拍《倚天屠龙记之魔教教主》，晚上还要拍《太极张三丰》，其中的高难度动作有些是由动作演员熊欣欣完成的。
在拍摄《倚天屠龙记之魔教教主》的时候，王晶作为这部戏的导演，就想把女一号赵敏这个角色给邱淑贞，不过，当时永盛电影公司的二把手向华胜得知以后就不愿意，向华胜要求让张敏来饰演赵敏这个角色，之后，王晶为了安抚邱淑贞，就让邱淑贞饰演了小昭这个角色。
在这部戏中，黎姿饰演的周芷若有一段戏份是她为张无忌擦汗的戏，李连杰当时因为害羞，导致这段戏多次NG，导演王晶就建议李连杰可以看黎姿的胳膊，而不用看着黎姿的脸，这样就不会那么害羞。拍摄这段戏的时候，李连杰额头上的汗其实是真汗，而不是道具。
导演王晶根据金庸的原著进行改编拍了这部《倚天屠龙记之魔教教主》，这部戏中的张无忌从以往的侠客变成了腹黑的教主，而周芷若也变成蛇蝎美人，张三丰也和以往形象不同，被观众称为是“胖版的周伯通”。
在影片结尾部分，张敏骑着白马的回眸一笑，其实并不是剧本设计，而是张敏即兴的发挥，导演王晶起初觉得张敏随便加戏还有点生气，不过，后来觉得张敏这个镜头很惊艳，就保留下来。
这部戏的武术指导是洪金宝，1977年的时候，洪金宝执导首部电影《三德和尚与舂米六》，为“功夫喜剧”电影打响头炮。此后，洪金宝主演《肥龙过江》、《赞先生与找钱华》，巩固了“功夫喜剧”领域的地位。
洪金宝获得了众多奖项和荣誉，包括第16届亚洲电影大奖终身成就奖、第42届香港电影金像奖终身成就奖、第9届纽约亚洲电影节亚洲之星终身成就奖、第18届远东电影节终身成就金桑树奖等。
当时在拍摄这部《倚天屠龙记之魔教教主》的时候，洪金宝一边担任武术指导，一边还在这部戏中客串了张三丰这个角色，虽然身材上和以往的张三丰不太符合，不过，洪金宝饰演的张三丰给这部戏增加加了许多喜剧亮点。
武术指导洪金宝设计的动作以硬桥硬马为主，如戏中张无忌大战少林龙爪手的戏份，张三丰传授太极的戏份，这些都融合了洪家班的实战风格。
洪金宝对和李连杰合作也是十分高兴，在谈到李连杰的时候，洪金宝说：“成龙的特技前无古人，李连杰的武术美学后无来者，他们代表了功夫片的两种巅峰。”
