在佛教神话中，被如来佛祖囚禁在灵山的最大妖王是名叫悟能的妖王。悟能是《西游记》中的一个重要角色，也是孙悟空的师弟。

悟能最初是一只凶恶的妖猴，居住在灵山上。他凶狠残暴，经常捣乱，威胁到人间和天界的安宁。为了制止悟能的恶行，如来佛祖亲自降临灵山，将悟能囚禁在那里。

悟能的囚禁在灵山的经历发生在《西游记》的前传《大闹天宫》中。孙悟空带领一群猴子闹天宫，悟空表现出惊人的力量和才华，甚至与天宫的众神斗智斗勇。然而，悟能的嚣张行为最终被如来佛祖发现，他亲自出面将悟能击败，并将他囚禁在灵山上。

悟能被囚禁在灵山后，经历了漫长的禁锢。在那里，他受到如来佛祖的严密监视和折磨，无法离开灵山。囚禁期间，悟能经历了身心的煎熬和反思。他认识到自己的傲慢和暴戾，以及自己给天界和人间带来的破坏。悟能逐渐觉悟，开始修行悔过自新。

通过长时间的禁锢和反思，悟能的心性发生了转变。他明白了自己的责任和使命，决心修炼成为一位善良而有益的存在。最终，悟能得到如来佛祖的赦免，成为佛门弟子，并在《西游记》中成为了孙悟空的师弟和战友。

悟能的囚禁在灵山的经历展示了佛教中的慈悲和悔过的理念。尽管悟能曾经犯下许多罪行，但他通过自我反省和修行，最终实现了心性的转变。如来佛祖的严厉惩罚和禁锢，虽然严苛，但也是为了让悟能能够认识到自己的错误，并有机会改过自新。

悟能的故事也启示了人们对于错误和罪过的反思和悔过的重要性。不论我们曾经犯下多少错误，只要我们有真诚的悔意和决心，就有机会通过修行和改变来追求正道和救赎。悟能的囚禁经历告诉我们，无论我们曾经有多恶劣，我们都有可能获得慈悲和宽恕，重新开始。

总而言之，被如来佛祖囚禁在灵山的最大妖王是悟能。悟能通过长时间的禁锢和反思，经历了心性的转变，并最终成为佛门弟子。他的故事向我们展示了悔过和改变的力量，以及在佛教中慈悲和宽恕的重要性。