在经过多次的改革调整之后，解放军总医院目前已经下辖着九个医学中心、五个在京医疗区（即京东医疗区、京南医疗区、京西医疗区、京北医疗区、京中医疗区）以及海南医院、研究生院。其中，解放军总医院第五医学中心是由原解放军第三0二医院和原解放军第三0七医院（即原军事医学科学院附属医院）于2018年11月合并组建而成的，中心在病原体感染导致的传染病和继发病、疑难重症肝病、血液病、肿瘤诊治等方面具有特色领先优势，现有南、北两个院区（均位于北京市丰台区）。
首先，介绍一下解放军第三〇二医院：第三〇二医院创建于1954年7月2日（其最早前身是于1939年11月组建的延安中央医院），医院曾是全军唯一、全国最大的三级甲等传染病院，同时也是当时我国指定的军队涉外医院、国家紧急救援网络医院，既服务部队官兵、又向全社会开放。2012年，解放军第三〇二医院曾入选《中国名医百强榜》，充分彰显了医院的强大综合实力和先进诊疗水平。
然后，再介绍一下解放军第三O七医院：第三O七医院也是一所集医疗、科研、教学、保障于一体的三级甲等医院（其前身是于1957年8月创建的原国家卫生部同位素医院），院区位于北京市丰台区东大街8号，对外也称作“军事医学科学院附属医院”。当时，该院还是北京西南地区规模最大的一所现代化医院（拥有两个全军医学专科研究所、四个全军医学专科中心），医院致力于以精湛技术为军民提供优质服务，在北京地区乃至全国都拥有相当的知名度。
2018年11月，根据部队医院系统的改革部署，原解放军第三0二医院、第三0七医院合并组建为解放军总医院第五医学中心，成为了联勤保障部队的重要组成部分。中心学科体系完备、医疗特色鲜明，现设有“感染病医学部、血液病医学部、肝病医学部、肿瘤医学部”以及7个国家和军队临床示范基地、4个全军研究所，曾多次受到党中央、国务院、中央军委的表彰，被誉为是“部队医院支援西部地区医院工作先进单位”、“全国抗疫先进集体”、“全军为部队服务先进医院”、“联勤保障部队先进师旅团党委”。
现阶段，解放军总医院第五医学中心在重大联合军演、重大任务保障、重大灾害救治中发挥着关键作用，在部分医学领域的临床研究与应用已经达到了国际国内先进水平。
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