襄阳大战后四十年，大雕进入弥留之际，杨过和小龙女带它进了不老长春谷。两人一雕通过饮用不老泉水，重返青春。
数十年过去，杨过和小龙女推演出“天长地久不老长春功”，将不老泉水精华转换为自身真气，渐渐勘破虚空之谜。
出谷后，杨过、小龙女重游故地，感慨世事沧桑，最后在张三丰的见证下，乘神雕破空而去。此后，张三丰也离开武当，不知所终。
第三次华山论剑后，杨过、小龙女带着神雕游遍大好河山，数年后回古墓隐居。又过了三十多年，杨过、小龙女都过了古稀之年，但由于他们内功深厚，驻颜有术，看上去不过四十许人。不过，一直跟随他们的大雕终于进入了垂暮之年，一身羽毛几乎落尽，行动迟缓，一日中倒有多半日，是在太阳底下昏昏欲睡。
一日中午，杨过给神雕拿来几只鲜果和一只野兔，却怎么也叫不醒它。杨过凝功于耳，发现它的呼吸极为微弱，急忙为它输送了一道真气，才把它救了回来。于是，杨过和小龙女商量，说神雕越来越虚弱，而且经常望着襄阳方向，应是感到大限已至，想重归故土。小龙女闻言默然，良久方说，过儿，如果有一个方法可以救回神雕，但代价是被困在一个地方不能出去，你愿不愿试试？
杨过叹了一口气，说神雕陪伴了我们数十年，早已是家中的一员，如果能让它延长寿命，再陪我们二三十年，我愿意冒险一试。更何况，我们的两个儿子都已有了自己的一番事业，不用我们操心：老大加入了明教，继续抗元大业；老二经营覆盖全国的情报网，为无数反元义士提供情报。如今，能用到我这把老骨头的，也只有神雕了。小龙女笑了笑说，那你听我讲一个故事，再做定夺。
四百多年前，在云南无量山深处的一个小山谷中，突然冒出一眼清泉。当地一位砍柴的老头儿喝了，只觉泉水清甜甘冽，登时神清气爽，自己好像年轻了几岁。当时他的手臂上已布满了黑褐色的老年斑，但他他喝下几口泉水，又去砍了一捆柴后，发现力气比往日大了许多，手臂上的老年斑也淡了许多，几不可见。
老头又儿惊又喜，很快便猜到自己这番变化与那泉水有关，他想赶快回家告诉老伴这个好消息，没想到刚出谷没几步，便觉眼前一黑，全身的力气急剧消失，被背上的柴禾压倒在地。再看手臂上的老年斑，不但恢复了黑褐色，数量还比喝泉水前多了一半。老头儿挣扎着回到了家，数日后便撒手人寰，但这泉水的神奇之处仍慢慢传了开来。
人们渐渐发现，饮用这口泉水，果然有返老还童之妙，但只在谷中有效，一旦出谷，便会加速衰老。试问一个健康的正常人，谁会愿意在一个小山谷中永远不出去呢？于是，这些谷中除了一些得了绝症之人，以及一些行将就木的老人，便再无其他人了。
数年后，一位面如冠玉、飘逸如仙的道人来到了山谷，找了一个山洞住下。道人日日饮用泉水，打坐练功。三年后的一日，谷中人只听得一声大笑，见道人卓立泉边，手指凌空虚划了十几下，旁边的山石上便多了“不老泉”三个大字。道士留完字，大笑着乘风而去。谷中人知道这定是一位仙人，而且已破解了泉水的秘密，纷纷去找他所住的山洞，想看看他有无留下什么秘笈仙术。然而他们找遍了山谷的各个角落，却一无所获。
又过了一百年，一位青年武者进了山谷。青年自称逍遥子，同样日日饮用不老泉水练功。半年后，天降暴雨如注，逍遥子草庐所在处发生山体滑坡，露出一个山洞。武者进了山洞，找到一本秘笈，名为“天长地久不老长春功”，署名为吕洞宾。逍遥子一练之下，发现正是转化不老泉水精华的法门。
七年后，逍遥子神功大成，飘然出谷，并带走了秘笈。此后数十年，逍遥子在“不老长春功”的基础上，先后创制出“小无相功”和“北冥神功”两大神功，并在无量山琅嬛玉洞开创了逍遥派，收下天山童姥、无崖子和李秋水三大弟子。九十年后，大理国主段誉携爱侣王语嫣来到山谷，想找到吕洞宾留下的“不老长春功”秘笈，永驻青春。在山洞中，他们发现当地人留下两行字：神书已随逍遥去，此地只余不老泉。
小龙女告诉杨过，古墓派的祖师林朝英，就是逍遥派的传人虚竹子的女儿。虚竹子机缘巧合之下，承接了无崖子、天山童姥和李秋水二百年功力，遂成一代绝顶高手。虚竹子曾和天山童姥相处多日，后者不仅传授了他不少逍遥派的绝学，还跟他说过不少门派秘辛，不老泉水的传说，就在其中。杨过听小龙女说完，像个孩子一样眉飞色舞，握紧小龙女的手说，姑姑，过儿此生能和你共偕白首，本已心满意足。但如今听你说起这不老泉水，心中又生出贪念，想和你千秋万世，永不分离。为了神雕，为了我们的未来，我们即刻出发去找不老泉吧。小龙女微微一笑，坚定地点了点头。
这次上路，神雕身体大不如前，因此两人一雕，走走停停，足足用了大半年时间，才来到了无量山。其间，杨过和小龙女轮番为神雕输入真气，但神雕的身体仍是一日不如一日。就在神雕进入弥留，杨过输入的真气已无济于事时，他们终于找到了那处山谷，并在神雕断气之前，给它饮下了不老泉水。
这不老泉水果有奇效，神雕饮下泉水，再加上杨龙二人为它输送真气，竟真的挺了过来。七日后，神雕已重新焕发生机，不再需要输入真气续命。二十一日后，神雕头顶的红瘤脱落，身上的羽毛纷纷脱落，然后又渐渐长出新的羽毛，而且不是此前黑灰夹杂，而是纯黑之色。四十九日后，神雕已恢复了初遇杨过时的力气，眼神锐利，翅膀展开足有七尺，是原来的两倍有余。更厉害的是，神雕原本不能飞翔，如今却能在天空展翅飞翔。它第一次要冲天而起时，把杨过吓了一大跳，好说歹说，才让它不飞出山谷范围。
再说杨过和小龙女，他们如神雕一般，每日饮用不老泉水，身体也发生了翻天覆地的变化。他们的皮肤先后蜕皮三次，变得晶莹如玉。气血充沛之极，达到了二十岁时的状态，甚至犹有过之。杨过头发本已半白半黑，此时已完全变成油亮的黑发。更厉害的是，杨过和小龙女都觉功力大有增长，试演各种武功，无一不圆融无碍，臻至完美境界。
杨过大喜之余，对小龙女说，如今他们已重返青春，下面要做的，就是推演出“不老长春功”，带着神雕一起出谷。于是，两人每日一边饮用不老泉水，一边推演功法。其实，杨过能重返青春，可与小龙女再度百年光阴，心中已颇为满足。而小龙女生性不爱热闹，只要与杨过在一起，无论古墓还是山谷，也都心满意足。
想那“不老长春功”，本是吕洞宾这样的仙人一流才能创出，杨龙二人天分虽高，毕竟还是凡人，重新推演出这门功法，可说是千难万难。但两人虽有此心，却并不如何热切，恰恰符合了“清静无为”的道家至理。谷中不知岁月，不知过了多少年，一日，杨龙二人竟真的将功法推演完毕。当然，他们推演出的功法未必就和“不老长春功”一模一样，但却同样能够将不老泉水的精华转化为真气。
杨龙二人足足用了三个月时间，将吸收的不老泉水精华全部转化成了自身真气。由于他们饮用的泉水实在太多，导致他们气海之内，真气渐渐变得如液体一般。在气海的中心，一颗黄豆大小的气丹渐渐成形。同时，两人还发现，就算自己不再饮用泉水和运功，全身三百六十五处窍穴，也在缓缓吸收着天地之间的能量。
此外，杨过还感觉到，天地间似乎有一张薄膜，隔开了另一方天地，自己只要轻轻一撕，便能进入。他刚想告诉小龙女，便见她轻轻点了点头，识海中收到一段信息，正是小龙女所悟，与他所感差相仿佛。这一刻，两人才发现，他们已经能够通过意识进行交流。接着，杨过唤来神雕，为它输入了大量的“不老长春功”真气。杨过意识到，这样已足以保证神雕不再受山谷的限制。
杨过和小龙女商量，再看看孩子，寻访一遍故人，便带着神雕去新的世界。然而，他们出谷后才发现，此时距他们入谷时，已足足过去了七十年之久，天下已发生了沧桑巨变。
他们的长子杨破天，十八岁时化名阳顶天加入明教，后成为明教教主，威震天下。但就在他们入谷二十八年后，阳顶天突然失踪，又过了三十年，才被发现是因成昆与他妻子私会，导致他练功时走火入魔，死在了秘道之中。所幸，后来有一位叫张无忌的少年，不但挫败了成昆覆灭明教的阴谋，还继承了阳顶天的遗志，带领义军反抗蒙远。后张无忌因故归隐，但义军却已在两年前将蒙古人赶回大漠，重建了汉人江山。
次子杨默，四十余岁才遇到命中的爱侣，后两人育有一女，唤作杨瑶琴。杨瑶琴天资聪颖，武学天分极高，将情报网络规模扩大到了西域和北疆，并使杨家成为天下巨富。此时，杨默夫妇早已故去，杨瑶琴成为古墓的主人。杨过和小龙女见他们的这位孙女，将一应事务打理得井井有条，便没有打扰她，飘然而去。
后来，杨过和小龙女偶然间得知，当年在华山有一面之缘的张三丰尚在人世，便乘着神雕来到了武当山。在武当金顶，满头白发的张三丰，看着一百余年前的故人，比当日还要年轻，饶是他已是半仙之体，仍是目瞪口呆。杨过和张三丰寒暄过后，看他有意大道，便向他传了一些自己的感悟。最后，杨过和小龙女乘上大雕，向张三丰挥了挥手，便破空飞去。
张三丰静静地凝望着他们消失的方向，半日后留下一封书信，便出了山门，从此不知所终。
