华大团队近日再获突破！由 Ying Lei、Yuxuan Liu、Mingli Wang 等领衔的研究团队，成功构建了猕猴屏状核的单细胞空间转录组图谱及全脑连接图，相关成果于 2025 年 4 月 3 日发表于《Cell》，为解析灵长类大脑高级功能提供了关键数据支撑。
一、屏状核：大脑 “瑞士军刀” 的未解之谜屏状核是位于大脑岛叶皮层下方的薄片状结构，与几乎所有皮层区域存在双向连接，被认为参与睡眠调节、注意力控制甚至意识调控。然而，其细胞类型的空间分布及全脑连接模式长期成谜。此次研究利用单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）和空间转录组技术，首次在单细胞分辨率下绘制了猕猴屏状核的分子与空间组织图谱，鉴定出多个新型细胞亚群，并解析了其与前额叶、海马等脑区的功能连接网络。
二、技术亮点：多组学整合破解脑区 “黑箱”研究团队结合10x Genomics 单细胞平台和Visium 空间转录组技术，对猕猴屏状核进行多维度分析：
单细胞分群：通过 Seurat 包聚类，鉴定出 12 种主要细胞类型，其中 3 类为屏状核特异性神经元，高表达调控突触可塑性的关键基因（如SLC17A7、GAD1）。空间定位：利用高斯过程模型映射细胞类型空间分布，发现抑制性神经元富集于屏状核中部，而兴奋性神经元呈梯度分布，与全脑投射靶点高度相关。连接组分析：结合病毒示踪技术，构建屏状核 - 皮层连接矩阵，揭示其通过谷氨酸能神经元投射调控前额叶认知功能的新机制。三、代码解析：从原始数据到功能验证研究公开了完整的数据分析流程，通过上述流程，团队验证了屏状核细胞类型的空间异质性，并发现其与皮层连接的分子标记物。
四、生信学习群开放：前沿文献实时共享面对单细胞、空间组学等前沿技术的井喷式发展，为帮助科研人员及时追踪领域动态，我们特别建立生信交流学习群，提供三大核心服务：
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屏状核是位于大脑岛叶皮层下方的一个薄的端脑结构，它与几乎所有的皮层区域都有相互连接，在大脑功能中发挥着至关重要的作用，包括睡眠调节、注意力引导、认知控制和意识等方面。然而，此前关于屏状核的分子和细胞组织仍存在许多未解之谜，其细胞类型的空间分布以及全脑连接情况也尚不明确。
