1975年秋，毛主席病重。同年10月，毛远新被安排担任毛主席的联络员，毛主席对侄子毛远新非常信任，可是毛远新在担任联络员期间却做了许多歪曲事实的汇报， 在毛主席去世之后，毛远新不可避免地受到了审查。

1976年10月，毛远新被隔离审查，此后他长期消失在公众视野里。1980年12月，毛远新被判处有期徒刑17年，刑期从他接受审查之日算起，不过毛远新在狱中只被关押了13年，1989年3月他就被批准保外就医。

离开监狱后，48岁的毛远新到了南昌，他被安排跟随母亲一起生活，也方便他照顾年迈的母亲。毛远新在经历了大起大落之后，终于与家人团聚了，妻子全秀凤也带着女儿赶到了南昌。

毛远新见到女儿之后高兴不已，可是女儿对他却有些抗拒，这让毛远新心里很不是滋味。1977年1月，当时毛远新还在被审查期间，全秀凤为他生下了女儿李莉，不幸的是李莉在10个月大的时候因高烧导致了失聪。

1982年，全秀凤带着女儿李莉到狱中看望毛远新，望着已经5岁的女儿，毛远新想抱一抱她，可是女儿对“陌生人”感到害怕，加上自幼失聪，李莉对外人很敏感，不肯让父亲毛远新抱一下。

妻子对毛远新诉说了女儿的遭遇，由于失聪导致女儿内向且胆小，毛远新认为是自己连累了女儿，对此十分自责。女儿给了毛远新活下去的动力和信心，让他一直坚持到了离开监狱。

1993年10月，毛远新刑满释放，组织上还为他安排了工作。毛远新被安排在上海汽车质量检测研究所工作，为了避免受到影响，他使用的是化名“李实”，此后他在上海和妻女团聚了。

毛远新是哈军工的高材生，研究所里的工作对他来说不难，很快他就成为了所里的技术骨干，两年后分管技术的副所长还建议提升他的职务，对此毛远新婉拒了，当时只有所长和政委知道毛远新的真实身份。

1997年，上海本地的一家报社报道了毛远新的工作近况，再次让毛远新进入了大众视野，同事们这才知道“李实”大有来头，不过大家对毛远新一如既往的尊重和友好，毕竟毛远新是有真本事的。

后来有传言说毛远新的腿瘸了，是在里面造成的。对此毛远新和老友杜修贤聊天时解释过，他是脊柱患病，造成的股骨头坏死，所以才不大方便。不过毛远新每天上下班仍是坚持骑自行车。

毛远新把工作之外的精力都放在了女儿李莉身上，他担心女儿不能说话长大了受委屈，常常独自一个人流泪。为了帮助女儿学习，他天天下班后就陪着女儿一起学习，李莉后来考上了聋哑成人教育大专班。

在毛远新的悉心教育和照顾下，李莉早已走上了工作岗位，有了自己的家庭。2001年，毛远新从单位退休了，同时他还享受烈士家属的待遇，如今八十多岁的毛远新过着幸福的晚年生活。