AbMole详解:PROTAC跨越不可成药,精准靶向蛋白降解

AbMole生物 2024-09-12 14:12:15

在生物医药领域,PROTAC(Proteolysis-Targeting Chimera,靶向蛋白降解嵌合体)技术正引领着一场革命,为那些传统难以成药的蛋白靶点提供了全新的成药思路。本文将结合该部分研究性文章及综述,给您简单介绍PROTAC技术的原理、发展历程、应用前景及其面临的挑战。

一PROTAC技术的基本原理

PROTAC技术是一种创新的靶向蛋白降解策略,通过小分子嵌合体同时招募目标蛋白(POI)和E3泛素连接酶,诱导目标蛋白的泛素化进而被蛋白酶体降解。这一过程实现了对目标蛋白的“催化性降解”,区别于传统小分子抑制剂的“一对一”结构抑制模式。PROTAC分子由三个主要部分组成:与目标蛋白结合的配体、与E3泛素连接酶结合的配体以及连接两者的连接子(Linker)。这种设计使得PROTAC分子能够像桥梁一样,将目标蛋白与E3泛素连接酶拉近,诱导目标蛋白的泛素化并被蛋白酶体识别降解(如图1所示)。

图1 PROTAC技术的基本原理:基于泛素化的蛋白降解途径

二.PROTAC技术的发展历程

PROTAC技术的概念最早可以追溯到2001年,由Sakamoto等人首次报道了首个全合成的PROTAC分子Protac-1,它成功地诱导了目标蛋白METAP2的降解。自那时起,PROTAC技术经历了从肽类PROTAC到全合成小分子PROTAC的演变,连接子长度的优化、配体亲和力的提升以及E3泛素连接酶种类的拓展,共同推动了PROTAC技术的快速发展。高品质抑制剂、细胞因子、人源单抗、天然产物、荧光染料、多肽,尽在AbMole。

近年来,随着多个PROTAC分子进入临床试验,并显示出良好的安全性和有效性,PROTAC技术的潜力得到了广泛认可。特别是针对雄激素受体(AR)和雌激素受体(ER)的PROTAC分子ARV-110和ARV-471,已经在前列腺癌和乳腺癌的治疗中展现出初步疗效,为PROTAC技术的临床应用奠定了坚实基础。

图2 PROTAC技术的发展历程

三.ROTAC技术的应用前景

1.攻克“不可成药”靶点

传统小分子药物往往难以作用于那些具有平坦、浅口袋活性位点或表面光滑、缺乏结合位点的蛋白。而PROTAC技术通过诱导蛋白降解而非直接抑制其活性,极大地扩展了可成药靶点的范围。许多在癌症和其他疾病中发挥关键作用的蛋白,因此有望成为PROTAC技术的新靶点。

图3 靶向不可成药的蛋白质的PROTAC

2.提高药物选择性

PROTAC分子通过同时结合目标蛋白和E3泛素连接酶,实现了对目标蛋白的高效、特异性降解。这种机制避免了传统小分子药物可能产生的脱靶效应,提高了药物的选择性和安全性。

3.克服耐药性

针对某些已经产生耐药性的蛋白靶点,PROTAC技术通过诱导其完全降解,而非简单抑制其功能,可能有效绕过耐药机制,为耐药性疾病的治疗提供新途径。

4.拓展治疗领域

目前,大多数进入临床试验的PROTAC分子集中在肿瘤领域。然而,随着技术的不断成熟,PROTAC技术有望在自身免疫性疾病、神经退行性疾病等领域发挥更大作用。例如,针对亨廷顿病、阿尔茨海默病等神经退行性疾病中的致病蛋白tau和α-突触核蛋白,PROTAC技术展现出潜在的降解能力。

四.PROTAC技术面临的挑战

尽管PROTAC技术展现出广阔的应用前景,但其发展仍面临诸多挑战:

1.药物设计复杂性

PROTAC分子的设计需要同时考虑目标蛋白配体和E3泛素连接酶配体的选择、连接子的长度和柔韧性等因素。这些因素的优化需要复杂的计算模拟和大量的实验验证,增加了药物研发的难度和成本。

2.药物代谢和药代动力学

PROTAC分子通常需要较高的有效浓度才能发挥作用,这对其药代动力学性质提出了更高要求。此外,PROTAC分子的体内稳定性和代谢途径也需要深入研究,以确保其在体内的有效性和安全性。AbMole是ChemBridge中国区官方指定合作伙伴。

3.免疫原性

对于某些PROTAC分子而言,其重复给药可能引发免疫反应,导致药物失效或产生不良反应。因此,在PROTAC分子的设计和临床应用中,需要充分评估其免疫原性风险。

4.新型E3泛素连接酶的开发

目前大多数PROTAC分子依赖于少数几种已知的E3泛素连接酶(如CRBN、VHL等)。然而,这些连接酶的基因组缺失或突变可能导致肿瘤细胞产生耐药性。因此,探索新型E3泛素连接酶并探索其在PROTAC技术中的应用显得尤为重要。

AbMole持续焦距生物医药最新进展,不断推出各种高品质活性分子,产品涉及信号通路、肿瘤、代谢、炎症免疫、神经科学、感染等研究领域和重要蛋白靶点。在PROTAC研究领域中AbMole为您推荐:

产品名称

目录号

功能描述

Bavdegalutamide (ARV-110)

M10306

一种特异性雄激素受体 (AR)的 PROTAC类降解剂

ACBI1

M13389

BAF ATPase亚基SMARCA2和SMARCA4 的PROTAC类降解剂

dTRIM24

M14870

TRIM24的PROTAC类降解剂,由von Hippel-Lindau 和TRIM24 两者配体组成

THAL-SNS-032

M14876

一种作用于CDK的 PROTAC类降解剂

Vepdegestrant (ARV-471)

M21158

基于CRBN的雌激素受体的PROTAC类降解剂

AU-15330

M31304

一种作用于SWI/SNF ATPase亚单位SMARCA2和SMARCA4的 PROTAC类降解剂

dBET57

M10380

选择性降解 BRD4 BD1的PROTAC类降解剂

PROTAC SGK3 degrader-1

M10382

是一种包含308-R SGK抑制剂与VH032 VHL结合配体的PROTAC,靶向降解SGK3

BSJ-03-123

M10379

种新型有效的CDK6选择性的小分子降解剂 (PROTAC)

Bis-PEG2-acid

M55356

一种PEG类的PROTAClinker

m-PEG-OH(MW5000)

M49797

一种PEG类的PROTAlinker

Thalidomide

M2225

一种 cereblon (cullin-4 E3 泛素连接酶复合物 CUL4-RBX1-DDB1)抑制剂

Thalidomide-O-amido-C4-NH2 (TFA)

M9837

一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker

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参考文献

[1] SUN X, GAO H, YANG Y, et al. PROTACs: great opportunities for academia and industry [J]. Signal transduction and targeted therapy, 2019, 4: 64.

[2] BéKéS M, LANGLEY D R, CREWS C M. PROTAC targeted protein degraders: the past is prologue [J]. Nature reviews Drug discovery, 2022, 21(3): 181-200.

[3] ZHANG C, LIU Y, LI G, et al. Targeting the undruggables-the power of protein degraders [J]. Science bulletin, 2024, 69(11): 1776-97.

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