《针灸甲乙经》，又叫《黄帝甲乙经》《黄帝三部针经》《黄帝针灸甲乙经》。此书是古代医家皇甫谧总结了魏晋以前的针灸学成就，吸收了《素问》《针经》《明堂孔穴针灸治要》的精华，删其浮辞，除其重复，做了十分繁重的选材整理工作，并加入了自己的实践经验而著成。

《针灸甲乙经》全书共12卷，128篇，卷一至卷六为中医基本理论和针灸基础知识，卷七至卷十二为临床治疗部分，包括各种疾病的病因病机、症状和腧穴主治。卷一主要论述人的生理功能以及脏腑与肢体五官的关系等。卷二论述十二经脉、奇经八脉、十二经标本、经脉的循行路线和发病情况以及骨度、肠度等。卷三为腧穴主治部分，共厘定了腧穴348个（其中单穴49个，双穴299个），并采用分部依线的方法，划分了头面、颈、胸、腹、四肢等35条线路。详细叙述了各穴的部位、针刺深度与灸的壮数。卷四叙述了诊法，包括望闻问切四诊的具体内容，重点论述了四时平脉与脏腑病脉、死脉以及三部九候的诊断方法。卷五为针道，详述了九针的形状、长度和作用、针刺的手法和补泻的方法、针刺的禁穴与禁忌等。卷六以阴阳五行学说为核心，论述了生理与病理方面的一些具体问题。从卷七至卷十二为临床治疗部分，包括内、外、妇、儿等科，尤以内科为重点，涉及多种病证，在治疗方面，书中介绍了晋以前针灸治疗各种疾病丰富而宝贵的经验，全书共列腧穴主治800多条，为后世针灸治疗学的发展打下了良好的基础。同时《针灸甲乙经》的腧穴和腧穴主治部分保存了已失传的《明堂孔穴针灸治要》的内容。

《针灸甲乙经》对针灸的发展起了承前启后的巨大作用，由晋到宋的针灸著作，如《铜人腧穴针灸图经》，其穴位和适应证基本上没有超出本书的范围。如《针灸资生经》等专著，无不遵循本书编辑而成。明清两代的针灸著作，如《针灸聚英》《针灸大成》等都是在本书基础上发展起来。《针灸甲乙经》还流传至日本、朝鲜，对两国的针灸学术与教育产生深远影响。