与古代奥运会一样，首届现代奥运会也是全男性的盛会。将女性排除在外主要是受当时的社会观念和性别角色限制以及国际奥委会主席顾拜旦的影响，他认为女性参与体育运动是不雅的。
虽然女性后来在 1900 年巴黎奥运会的高尔夫球和网球项目中首次亮相，但顾拜旦在其职业生涯的余下时间里仍然顽固地反对奥林匹克女运动员，
他曾写道，奥运会应该是“庄严的、周期性的男性体育精神的升华，以国际主义为基础，以忠诚为手段，以艺术为背景，以女性的掌声为奖励”。
2.希腊差点成为永久举办地首届现代奥运会有人提议将雅典作为奥运会的永久举办地，这一想法与奥运会的复兴紧密相关。1896年首届奥运会的成功举办在很大程度上得益于希腊人民的热情和对古代奥运会传统的尊重。
在奥运会筹备期间，希腊政府和民众都投入了大量资源和热情来确保首届奥运会能够顺利进行，他们重建了泛雅典体育场。但顾拜旦和其他国际奥委会成员希望奥运会成为一项国际赛事，以此促进世界和平。因此希腊的提议未能成功。
3.获奖者没有获得金牌首届现代奥运会的冠军获得的是银牌、证书和橄榄花环，亚军获得的是铜牌和月桂花环，而一无所获的季军则是最倒霉的。
直到1904年在美国圣路易斯举行的第三届现代奥运会，金牌才开始成为对冠军的正式奖励，一直延续至今。
4.在公海举办游泳比赛首届奥林匹克运动会的游泳比赛是在希腊比雷埃夫斯附近的齐亚湾举办，只有4个项目，分别是100米自由泳、500米自由泳和1200米自由泳和一个专属希腊海军的“100米皇家海军水手赛”。
用长绳穿成一条线的空心南瓜作为隔开泳道的标志物，先用小船把运动员载到海中搭建的平台，运动员再由平台向岸边出发。
对于习惯了游泳池舒适环境的运动员来说，水温骤降加上狂风及海浪让许多比赛变成了与大自然的搏斗，500米比赛有29人报名，而参赛的只有3人。
阿尔弗雷德·哈约斯
匈牙利冠军阿尔弗雷德·哈约斯后来在1500米比赛中用油脂涂抹身体以抵御寒冷，他后来谈到低温折磨时说：“我的求生意志完全战胜了对胜利的渴望。我带着强大的决心划过水面，直到赛艇朝我的方向驶来，并开始捞出那些麻木的选手，他们放弃了挣扎，我才变得平静下来”。
5.大多数国家没有派出奥运官方代表队尽管顾拜旦和国际奥林匹克委员会竭尽全力，但1896年奥运会在希腊以外的地区却鲜有人问津。
大多数国家都懒得派出官方代表，而禁止职业运动员参赛的规定也让许多世界顶级运动员无法参赛。
例如，美国队由14 名大学和业余运动员组成，他们自费前往雅典。队员托马斯·柯蒂斯后来写道：“实际上，我们是自己选拔自己。其他许多参赛者都是当地的希腊人，甚至是偶然发现比赛并决定报名参赛的度假者。”
这些意外奥运选手中最有名的是爱尔兰人约翰·博兰，当时他以观众身份前往雅典度假，在朋友的帮助下报名参加了网球比赛。
博兰德不得不凑了一把球拍，穿着皮底鞋上场比赛，但最终他在单打和双打比赛中都取得了胜利。
6.从未扔过铁饼的铁饼冠军美国普林斯顿大学生罗伯特·加勒特在铁饼还未被引入国际赛事时，他便自制了一个10公斤重的铁饼用来训练。由于自制铁饼的重量过大，最终他放弃了这个训练方式。
罗伯特·加勒特
直到他抵达雅典，他才发现正式比赛中使用的铁饼只有2公斤重，于是便报名参加了比赛，并最终掷出了29.15米的距离，超过了舆论普遍认为可以稳操胜券的希腊选手帕纳吉奥蒂斯·帕拉斯克沃普洛斯的19.5厘米，获得了冠军，除此之外他还赢得了跳远的金牌以及铅球和三级跳远的银牌。
7.设立马拉松首届马拉松比赛比今天的马拉松短一些，全程大约40公里，与今天标准的42.195公里的马拉松距离略有不同，但事实证明其艰苦程度丝毫不亚于马拉松。
约有一半的参赛者因体力不支而被迫退出，还有一名参赛者在比赛的一部分时间里跳上了马车，因而被取消了比赛资格。
斯皮里顿·路易斯
最后的胜利者是斯皮里顿·路易斯，他是一名默默无闻的希腊村民，以稳定的步伐完成了比赛，中途还停下来吃了一个鸡蛋，喝了一杯酒。当他步履蹒跚地走进体育场时，迎接他的是巨大的欢呼声。
当他冲过终点线时，希腊王室的王子们甚至与他并肩奔跑。他以2小时58分50秒的成绩完成比赛，领先第二名约7分钟，成为了首届现代奥运会的马拉松冠军。但他在奥运夺冠后就回到了自己的村庄，再也没有参加过任何比赛。
从第一届现代奥运会开始，把男子马拉松比赛放在最后进行就成为了一项传统，而且终点都设在主体育场内。
