1528年春，嘉靖帝发了脾气，将已经身怀有孕的陈皇后狠狠斥责一顿，导致陈皇后滑胎；即便如此嘉靖帝还是强行将陈皇后挪出了坤宁宫，陈皇后在惊惧中仅仅几个月后便病逝了。陈皇后是嘉靖帝发妻，1521年在明武宗朱厚照无后而终后，嘉靖帝“兄终弟及”继承皇位。

次年嘉靖帝选秀，挑选了秀才陈万言的女儿为后，举行大婚。陈万言出身书香门第，从小便心怀大志、博览群书，年纪尚小时便已经诸生之首。奈何陈万言虽满腹才华，但就是科举不中，一直到50岁时还只是一个生员。不过因为女儿被册封为皇后，父凭女贵被擢升为鸿胪寺卿，之后又被授予正一品的中军都督府同知一职。而且在嘉靖三年，嘉靖帝更是不顾群臣反对，又给了岳父800顷民田。嘉靖十四年，嘉靖帝在陈皇后病逝7年后，突然想起陈皇后的贤淑美德，赠予陈万言太子太保衔。看嘉靖帝对待陈皇后的娘家人，可见嘉靖帝对陈皇后还是比较重视的。但为何对已经身怀有孕的陈皇后如此过分呢？其实帝后之所以失和是因为一件很小的事情：了解明史的应该知道，明朝的皇后一般出身都比较低，这是因为太子皇帝朱元璋留下的祖训，为的就是防止外戚专权、把持朝政。如此一来，想要被选为皇后或者是妃嫔，只能是凭借自己的贤德与美貌。陈皇后生的很漂亮，得以选为嘉靖帝皇后。这一年，陈皇后尚且只有15岁。而出身较低的皇后想要稳坐皇后之位，不能依靠娘家，便只有一条路可走：得到皇帝的宠爱，生下嫡子，嫡子被封为太子，皇后便是未来的皇太后。陈皇后自然很清楚这一事实，所以在得宠于嘉靖帝的同时，想方设法怀孕生下皇子。嘉靖七年，陈皇后终于得偿所愿，得以怀孕。怀孕的陈皇后自然也要提防哪一位妃嫔钻了空子，趁机得到嘉靖帝的盛宠，进而威胁到自己的地位。

而正因为陈皇后此举，不仅差点被废掉后位，还害了腹中的孩子。这年春，嘉靖帝陪着陈皇后一起喝茶，陪伴嘉靖帝与陈皇后左右的还有张妃（嘉靖帝继后）与文妃。嘉靖帝看了一眼妃子的手臂，陈皇后便吃醋一下子将手中的杯子摔了。很显然，吃醋的陈皇后没有意识到自己虽然是嘉靖帝发妻，但嘉靖帝是一国之君，作为皇后又如何能在皇帝面前如此无礼呢？更何况嘉靖帝本就生性古怪，又如何能忍呢？盛怒之下，嘉靖帝便发了好大的脾气，吓得陈皇后直接流产。流产后的陈皇后不仅没有得到嘉靖帝的宽恕，反而被嘉靖帝下旨，直接挪出了坤宁宫。并且嘉靖帝已经有了废后的意思，虽然明朝时期废后没有清朝时那般难，但也需要正当的理由才可以。嘉靖帝便召来内阁首辅杨一清等人商量废后的事情，众臣商议后，回禀嘉靖帝：陈皇后此时已经病危，若是废后会损害嘉靖帝的声誉，着实不妥。嘉靖帝认为有道理，便没有废后。

流产后陈皇后的身体便大不如前，再加上一直害怕伤心，这年十月便病逝了，年仅21岁。此时的嘉靖帝尚且在气头上，不仅大大降低了安葬陈皇后的规格，而且为其取了一个恶谥“悼灵”皇后。陈皇后作为嫡后，理应葬入帝陵，但嘉靖帝不仅没有将其葬入帝陵，而且哪怕是有朝臣劝谏，嘉靖帝也一概不听。就这样，嘉靖帝的第一位皇后草草结束了自己7年为后生涯。陈皇后病逝后，张妃被册封为继后。不过张皇后仅在后位7年的时间，因得罪嘉靖帝而被废，在冷宫待了一年便病逝了。不得不承认，做嘉靖帝的皇后真难。嘉靖十五年，此时陈皇后已经去世8年之久，嘉靖帝对陈皇后的怒气早已消了。在礼部尚书夏言的请奏下，嘉靖帝为发妻改谥：孝洁皇后。但即便是如此，嘉靖帝也没有陈皇后迁葬入帝陵。嘉靖四十五年嘉靖帝病逝后，明穆宗继位。群臣上奏穆宗：孝洁皇后是大行皇帝的原配发妻，按照祖制应当与先帝合葬。若是遵从先帝遗诏将孝烈方皇后（嘉靖帝第三位皇后，曾救了嘉靖帝的命）合葬帝陵，岂非舍弃原配；若是同葬帝陵，则是两位皇后陪葬帝陵。

穆宗听从群臣劝说，为嫡母上谥号“孝洁肃皇后”，附帝谥，并且将其迁葬帝陵，神牌供奉于太庙嘉靖帝神牌侧。如此一来，孝洁肃皇后陈氏在死后三十八年，终于得到了自己作为嫡后的待遇。