基因编辑成功“杀”入肠道:在原位改变细菌基因

向雪的手记 2024-07-28 10:02:34

7月10日,Nature期刊发出了一篇研究长文,所有17位作者的第一单位都是一家公司,只有1位最后通讯作者列了第二单位。这么纯粹,可以说是完全由公司主导的顶尖论文,在我读过的文章里,还真是没见到过。它是总部位于法国巴黎,但是创始人班底非常豪华的Eligo公司团队完成的,在小鼠肠道原位编辑细菌基因的研究。

Eligo公司的技术源于美国,诞生在两位基因编辑大牛的实验室。一位是洛克菲勒大学的Luciano Marraffini(卢西亚诺·马拉夫尼)教授,是最早阐明CRISPR-Cas系统在分子水平上如何工作的科学家之一。另一位是麻省理工学院的卢冠达教授,这位科学、产业多栖明星早在2008年就在合成生物学领域暂露头角。

左:Luciano Marraffini 右:卢冠达

这两位教授的实验室,当年都不约而同在关注如何用噬菌体作为载体,用CRISPR去编辑细菌的基因。马拉夫尼关注的是金黄色葡萄球菌(革兰氏阳性),卢冠达关注的是大肠杆菌(革兰氏阴性)。

卢冠达的学生Xavier Duportet(沙维耶·杜伯特)博士,在跟马拉夫尼的博士后David Bikard(大卫·比卡德)博士是好友,他们推动了两个实验室的数据共享和科研合作,并将各自的成果发表在Nature Biotechnology上。2014年,杜伯特和比卡德主导创立了Eligo公司,马拉夫尼和卢冠达两位教授也作为联合创始人加入其中。

左:Xavier Duportet 右:David Bikard

Eligo很快成为业内的明星公司,融资不断,充足的资金切实支持了自身的研究工作。最新这篇Nature文章,可以说是他们专业研究能力的登峰造极呈现了——在小鼠肠道中原位编辑了大肠杆菌β-内酰胺酶基因,单次剂量的中位编辑效率达到93%,且编辑过的细菌在小鼠肠道中稳定存在至少42天,体内研究完美成功!除此之外,体外针对更多细菌的基因编辑也行之有效。

在Eligo公司官网的介绍中,针对肠道细菌的体内CRISPR编辑,同样可进行基因敲除、修改或导入。这是CRISPR的绝佳应用场景之一!

不过需要多提一句,针对肠道菌群的干预方法,在从实验室走向成功转化的路上,很难一帆风顺。卢冠达教授参与创立的另一家公司,做工程菌的Synlogic公司,在今年宣布停止运营,还是很让人遗憾的。

不过无论如何,要向先行者致敬,期待Eligo公司的探索最终能成功!

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