生命的复杂性不是一步步增加的，而是一次“算法突变”直接改写了进化的底层代码。
西班牙、德国、瑞士四地科学家联合发表在《PNAS》的研究指出，真核细胞的诞生，本质上是一次“演化算法的相变”。不是线性的累积，而是结构性的突变，节点就在26亿年前——基因平均长度超过1500个碱基对的那一刻。
在那之前，生命只会写“短程序”——原核生物的蛋白质编码基因短小精悍，平均蛋白长度稳定上升，基因长度和蛋白质长度之间几乎线性同步增长。这是一个典型的乘法随机过程，全基因组数据拟合出一个极佳的对数正态分布。
科研团队分析了33,627个基因组和9,913个蛋白质组，发现整个生命树在编码蛋白的方式上表现出一致的增长规律：基因越长，变异越复杂，结构越多样，整体分布符合指数演化。但它也埋下了一个定时炸弹。
炸弹引爆于“1500个碱基”这个临界值。
从这一点开始，平均蛋白长度不再增长，稳定在大约500个氨基酸。而基因本身却继续延长，出现大段不编码任何蛋白质的序列——非编码区。这种“增长不再等于功能”的分裂，是算法无法继续沿用旧路径的表现。
研究称这是一次“算法相变”。
在磁性物理中，相变意味着体系能态结构的突变，比如从铁磁到顺磁。而在基因演化中，这意味着旧的搜索算法——逐步增加基因长度以产生新蛋白——在复杂度过高时彻底崩溃，系统被困在大量元稳定态中，搜索效率迅速下降，进入所谓的“临界减慢”。
蛋白质再长，结构再复杂，如果它和基因同步增长，系统必须进行指数级别的搜索以维持进化效率。而生命没有那么多时间等待一次有意义的突变。算法崩了，旧的增长策略死了。
解决方式也不是渐进的，而是体系结构突变：
非编码序列的大量引入，剪接体的出现，转录与翻译的空间分离，全都出现在这一历史点上。翻译不再直通基因，而是转录出前体mRNA，再由剪接体决定真正要翻译的片段。基因变成了“搜索空间”，不是“指令集”。
生命从写命令，变成写函数。而系统搜索的复杂度，从指数回落到多项式，甚至更低。
这个变化是可量化的。研究者提出，只需知道一个物种的平均蛋白质编码基因长度，就可以推算出整个物种的基因长度分布，这种缩放不变性（scale-invariance）贯穿整个进化树。这也是为何复杂生命出现之后，基因长度不再等于蛋白复杂度，而是开启了“调控、剪接、多态”的新世界。
在原核世界，基因是秩序。在真核世界，基因是空间。
一个空间里，有函数，有注释，有备用模块，甚至还有从不调用的残片。不是为了“意义”，而是为了搜索速度。多样性从不是目标，而是副产物。
而所有这一切，是一个算法在崩溃边缘自我改写的结果。
更重要的是，研究者从早期原始真核生物——原生动物、真菌等群体中观察到了这种过渡状态：系统被困在多个元稳定态之间，剪接机制尚不成熟，非编码区比例刚刚突破关键值，动态变慢，演化卡顿。
这也解释了真核细胞在地球演化史中的“突然涌现”问题。
为什么前面几十亿年都在做简单重复，而一旦突破之后，各类复杂结构在短时间内迅速爆发？为什么原核系统没有留下一条渐进过渡路径？不是没留下，是物理上不存在。
过去我们说进化靠自然选择，靠突变筛选。现在，至少在这个节点上，演化也靠算法、靠架构。真正的“复杂性”不是器官的数量，而是遗传信息的处理机制——剪接、调控、模块化、异构、重构。
