1952年，王恩茂接替主持新疆全面工作，王震被调离新疆。在很多人看来，是上级对他另有重用吧。事实上，真实情况是什么样呢？
1949年，王震指挥1兵团进军新疆，对新疆的和平解放和后续发展做出巨大贡献，并担任西北局委员，新疆分局第一书记，新疆军区第一副司令员、代司令员等职。
在新疆工作的2年多时间，开展生产运动、剿灭土匪的同时，减租反霸和土地改革。在牧区改革上起了风波。
新疆有广阔的牧区，三分之一的县以畜牧业为主，但其他县的畜牧业占比也很重。牧区里，还残存着封建氏族之多，王公贵族、部落头目占有大量草场和牲畜，并享有种种特权。当减租反霸接受，全疆展开土地改革，在土地改革的同时，牧区也进行改革。
在改革之前，王震派工作组进行一番社会调查。如果不对牧区问题解决，群众还是不能彻底翻身。有人提出土改可以，牲畜不动，他们带着畜群进山，会给我们带来很多麻烦。西北局致电新疆分局，应该集中进行土改，牧区暂时维持现状；中央也表明，暂时不动。面对上面的指示，下面还在执行牧区改革。上级为解决新疆分局在牧区工作中错误，因此免去他的分局第一书记，新军区政委等职，但依然是分局常委、军区副司令代理司令。作为副手的王恩茂担任分局第一书记兼新疆军区政委、新疆财委主任。
在1979年针对这个问题进行平反，不过都是后话了。
离开新疆后，没有被立即安排工作，因为身体有恙，让去苏联治疗。为此，中央首长接见他，谈到了新疆的问题。上级说：领导者应该站在矛盾之上，要注意主要矛盾和次要矛盾，以及矛盾的各个侧面。你的性格不适宜在环境复杂矛盾多的地方工作，不在矛盾之上，看在矛盾之中，自己很被动。
同时也说到，就新疆范围里讲，也许可能同时改革。但只看到新疆，没有看到全局，全局就是包括少数民族地区的不少，新疆突破中央的部署，势必会影响周围省份，西藏、甘肃、宁夏、内蒙古都有牧区，这样一来是的中央被动，无法应付。通过上级的谈话，让他在思想上通了，也有了一个新高度。
谈话后，他要求分配工作给自己，最终调他去主持铁道兵工作。铁道兵主要负责铁路建设，王震过去在南泥湾开垦搞大生产，解放后在新疆搞得轰轰烈烈。对于艰苦奋斗的精神，王震身上一直具备，也是一面旗帜。让他负责，可以说再合适不过。
1954年，他担任铁道部司令兼政委。1956年调任新成立的农垦部部长，继续负责农业生产，这些农垦区都在新疆、海南、黑龙江等地。从此以后，脱下军装，负责全国军垦农场和地方经营的国营农场。这让他有更大的发挥空间，为解决新中国粮食等农作物紧缺做出很大贡献。
在农垦部部长的位置上工作10年。七八十年代，担任国务院要职。
