我们能够较容易地追溯瓦加杜古的历史，得益于纳巴的宗谱官将历史以口头的方式传承下来。根据这些口述，可以确定莫西王国发展的两个主要阶段，一是16和17世纪，莫西人定居在白沃尔特盆地，但莫西王国的宫殿的地点并不固定，二是18世纪起，纳巴开始定居在瓦加杜古。
“不安分”的莫罗·纳巴宫殿16世纪莫西王国的瓦加杜古王国由纳科姆斯人建立，在16世纪至19世纪不断向邻国扩张，17世纪，瓦加杜古开始成为莫罗·纳巴陵墓的建造地，在18世纪藏布里纳巴将瓦加杜古选为都城，这说明瓦加杜古是一座较晚发展起来的城市，即使已成为首都，学界因其城市建筑过于简单，仍然对其城市身份存疑。
但在其城内围绕着宫殿和广场划分了不同的社会团体（部落首领，宫内官员、仆人及其家眷，商人）生活区域，使其城市特质凸显出来。19世纪，莫罗·纳巴鼓励人口进入瓦加杜古，响应号召的迪乌拉商人和豪萨商人进入城内，打破了本地雅尔加商人的商业垄断。
米歇尔·伊扎德将莫西王国分为南莫西王国和北莫西王国：北莫西王国是13-15世纪存在于尼日尔境内的莫西王国，他们的军事活动只限于尼日尔境内，存在的时间大约是1250-1575年；南莫西王国是指存在于白沃尔特盆地的莫西王国，也被称为纳科姆斯王国，纳科姆斯指16世纪来自南部甘巴加王国（今加纳）的战士，他们当时征服了此地，南莫西王国的历史只能追溯到15世纪后半叶。
16世纪是一个征服的时代，纳科姆斯征服了现瓦加杜古境内的本土村落，并在此建立了瓦加杜古，亚滕加，腾科多戈，法达恩古马四个王国。瓦加杜古王国的边界在堪旦耶纳巴统治时期（1540-1567）确定下来，直到19世纪才改变。
王国的范围使纳巴不得不把他的儿子们安置在可能不受他控制的地区，于是儿子们就建立了一个逐渐脱离纳巴控制的地方性权力中心。与此同时，纳巴继续对邻国采取军事行动。因此，从乌布里纳巴(1495-1518)到科阿布加纳巴(1681-1695)，王室的宫殿通常在军事行动地区附近。
虽然宫殿的这种迁移与每个纳巴想要摆脱先前历任纳巴固有统治模式的愿望有一定关系，但更为多情况下的是出于军事战略的考虑。在17世纪，瓦加杜古连续被多个纳巴尤其是亚德佛纳巴，1620-1661）作为都城位置的首选城市，但只有在18世纪藏博瑞纳巴（1744-1784）执政期间，它才成功成为了王国的都城。
由此看出，似乎并不能从传统上寻找到定都于瓦加杜古的原因而瓦加杜古这个城市名的来源也引起了不少的争论。拉西纳·辛波雷曾对这个词展开了研究，在他看来，关于这个名字的起源主要有两种说法:一种猜其可能是纳科姆斯族入侵之前的当地市场的名字。
另一种是根据王国官方说法称，这个名字最初是由王国第一个纳巴乌布里纳巴（1495-1518）提出，当地土著十分欢迎乌布里纳巴的到来，因此高兴的乌布利纳巴给此地赐名“沃格杜古”，意思是“尊重”。而语言学家对这个词的词义给出的不同猜测:有人说“抵抗莫西人入侵”，有人说“新发现的区域”，还有人说“尊重”。
17世纪末，在藏纳纳巴（1693-1702）的统治下，瓦加杜古成为了莫罗·纳巴陵墓的首选之地。到18世纪和19世纪，尽管纳巴中有些人生前未曾居住在瓦加杜古，例如瓦尔加纳巴（1737-1744)，有些人也并不在那里逝世，例如胡尔古纳巴（1796-1825），但所有的纳巴被都被埋葬在那里。
纳巴定居这一做法最先竟是由一个先后在七个不同地方建立宫殿的游牧民族的纳巴——瓦尔加纳巴（1737-1744）开启。他先是设立了一个由各个地方性首领组成的国王委员会，且要求这些地方性首领每天早上都要聚集在他的宫殿里开会，这一做法使得从那时起，纳巴就不再经常迁都，到19世纪末期，纳巴已完全定都于瓦加杜古。
纳巴的历史与莫西王国的历史是密不可分的，16世纪和17世纪的首领对18世纪和19世纪的该地区的政治格局造成了深刻的影响。在16和17世纪，纳巴创造了众多王室住所，而到18和19世纪，所有的莫罗·纳巴都定都于瓦加杜古。
瓦尔加纳巴还进行了一项具有决定性的政治改革，他设立了一个法庭机构，该机构将原本时常迁移的王室宫殿固定下来，从而起到了加强中央权力的作用。事实上，作为瓦尔加纳巴的继承人，藏布里纳巴（1744-1784）在其执政期间也一直将瓦加杜古作为整个莫西王国的首都。
莫西王国在18世纪上半叶也承认了瓦加杜古作为其都城。于是在18世纪末，这座城市成为莫罗·纳巴登基的地方，同时，它也被指定为纳巴的登基和王室的葬礼两类重要的皇室仪式的举办地。
综上所述，瓦加杜古在西非地区是相对较晚发展起来的一个城市，因为它的发展仅可以追溯到18世纪中叶，即王室定都于此的时候。早期的欧洲探险家听闻过西非莫西王国的盛名，但瓦加杜古并不符合他们对于该王国都城的想象，他们觉得其都城应当要比当时的瓦加杜古更为宏伟。
宾戈尔和克罗扎特分别于1889年和1891年到达此处，他们不约而同地对其乡村型的城市格局及乡野建筑风格感到惊讶。事实上，当时的瓦加杜古也的确与19世纪非洲许多村庄并无二致，农业和牧业活动仍是城市内的较为重要的活动，按种族划分社群且各社群之间分布松散，市内人口密度很低。
事实上，以上这些特征基本达不到城市的标准。在许多历史地理学家眼中，瓦加杜古在法国入侵之前，甚至在殖民时期，也仅仅只是一个村庄而已 。
或者说瓦加杜古并不是一个“历史悠久的大城市”，即使进入20世纪，这里的居民和19世纪的居民一样，保持着一种乡村感 。但他们的判断与事实相悖，自18世纪中叶起，瓦加杜古就已经成为一个都城，莫罗·纳巴们掌控着这块土地，并不断进行着城市空间的建设
