商务部发布公告，指认台湾对大陆贸易限制构成贸易壁垒，这一消息一经公布，立即在岛内引发广泛热议。台当局第一时间回应，表达愿意协商的意愿。根据岛内媒体报道，台行政机构经贸办表示，大陆此举“违反WTO相关机制与规范”，并呼吁大陆停止“政治操作”。经贸办指出，两岸同属WTO成员，应依循WTO机制与规则处理相关贸易问题。然而，大陆方面的态度相对简洁，国台办发言人朱凤莲表示，调查事实清晰，证据确实充分，支持主管部门最终调查结论。

在台湾，各界对此议论纷纷。台湾工商协进会发表声明，强调大陆是台湾最大的贸易伙伴，对于台湾经济发展至关重要。声明称大陆的调查结果“令人遗憾”，呼吁台当局“审慎应对”，兼顾公平贸易与维护台湾产业权益。台湾商业总会理事长许舒博表示，台当局应该思考大陆是否会取消ECFA，特别是在农渔产品方面，必须寻找新的市场。然而，他也坦言，大陆市场在某些方面具备“不可替代性”。

与此形成鲜明对比的是，大陆方面的回应相对简明。国台办发言人朱凤莲表示，对于台湾方面的贸易限制，不符合ECFA的精神与条款，支持采取相应措施。她指责民进党制造对立，煽动舆论，将问题闹大。相较于台湾方面的情绪化表态，大陆似乎更注重事实和结论。

有观察人士指出，大陆方面的公告并未公布详细细节，也没有明确制裁或反制裁的方式，这可能是出于两方面的考虑。一方面，观望台湾地区选举结果，判断是否有对话空间；另一方面，保留一定弹性，视台湾地区反应而定。

综合而言，这一贸易争端对两岸经贸关系产生深远影响。如何处理这场争端，以及未来两岸经贸走向，仍是备受关注的焦点。台湾方面在处理中需更加冷静理性，兼顾双方共同利益，而大陆方面则需要保持明晰的态度，维护自身权益。