1957年11月，埃及与叙利亚两国在原则上达成了合并协议。埃及总统纳赛尔任阿联的总统，开罗被定为首都。叙利亚总统库阿特利为副总统，原来的埃及和叙利亚分别成为阿联的南北两个行政区，各自成立地方政府，直属中央政府。

1958年2月1日，埃及和叙利亚召开两国的议会联席会议，会议宣告，埃、叙两国合并为阿拉伯联合共和国。3月8日，北也门也加入阿拉伯联合共和国（简称阿联）。

埃及和叙利亚并没有共同的边界，相距约600英里之远。埃及与叙利亚合并的准备至少早在1956年7月就已开始了，当时的叙利亚议会已经指派了一个委员会同埃及谈判组织一个联合邦，旨在共同对付巴格达条约组织成员国土耳其、伊拉克、约旦及其支持者美国等。

合并之后，外交和国防实行统一领导、统一行动，预算、财政和币制则至少在5年内各行其道，但贸易和经济措施将尽快一致起来。

两个主权国家的合并往往总是一个痛苦的过程。各自在政治、经济、文化等方面存在的不一致很难在短期内加以调和，甚至会引起矛盾冲突。埃及的一些政策在叙利亚推行后引起叙利亚人的强烈不满。如埃及的严厉经济措施使叙利亚的所有进口物品也必须同样经过批准，这就引起了叙利亚商人的反对；再如埃及的土地改革扩及叙利亚，也引起了一些波动；此外，一些叙利亚政治家和军人也对合并产生了反对情绪。

1961年9月，叙利亚军队发动政变，宣布退出阿联，另外成立叙利亚阿拉伯共和国。纳赛尔试图武力镇压叙利亚政变，未能成功，只得承认了现实。同年12月，也门宣布退出阿联。埃及仍用“阿联”的国名直到70年代才更改。