(1)痛经主要症状:为继发性且逐年加重，但也有少数病人无明显的痛经。异位的子宫内膜受卵巢激素的作用，与正常子宫内膜有同样的周期性变化，月经后半期，异位的内膜高度增厚充血，子宫内膜异位瘤内压力逐渐增加，行经时经血聚积囊内，使囊壁承受的压力骤然增加而引起疼痛。因此，子宫内膜异位症痛经的特点多从月经前甚至周期后半期开始，持续整个月经期至月经后数日消失。疼痛部位多在下腹正中，或偏于一侧，病变浸及子宫直肠。月经过多，月经血量多，也是临床常见症状之一，一般月经周期规律表现为经血过多或带经日久。
(2)性交痛:宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症均可发生性交痛，而且常于月经前较为明显。
(3)不孕:30-70% 子宫内膜异位症患者伴有不孕症，在原因不明的不孕症患者中约70-80%的患者伴有子宫内膜异位症，患者常因盆腔器官粘连，使输卵管蠕动受阻或输卵管堵塞等机械因素导致不孕，亦可能为卵巢功能不全，自身免疫反应增强，前列腺素增加，泌乳素增高等因素有关。
(4)卵巢子宫内膜囊肿:壁较脆缺乏弹性，经血逐渐聚积，囊内压力不断增高，内容物可自囊壁的薄弱部位溃破，溢入腹腔刺激腹膜，引起腹膜炎，出现急腹症。
发病原因：
机体因素（55%）：巧克力囊肿是因为盆腔里有异位的子宫内膜生长，这种内膜每月也有一次月经样出血，这些出血积聚在盆腔等处而成为囊肿。囊肿常是双侧性的，囊肿的内容物是月经血，其中水分被吸收、血液被浓缩成为深咖啡色、质地粘稠的糊，看上去很象巧克力所以叫“巧克力囊肿”。
年龄因素（40%）：巧克力囊肿主要发生在30-40岁之间的中青年妇女。主要是由于月经期子宫壁脱落的子宫内膜碎片因引流不畅，不能全部从阴道排出，有少量经输卵管向盆腔倒流。卵巢巧克力囊肿的病因尚未清楚，环境因素、生活习惯、精神状态等都可能与卵巢囊肿的发病有关系，但与已婚未婚没有什么关系。所以，卵巢囊肿可以发生在任何年龄段，一般高发于20-50岁女性，未婚女性患如发现有月经失调、经量减少甚至腹痛等症状时，应提高警惕，及时检查，特别是身材偏胖的青少年女性更需注意。
其他因素（5%）：(1)痛经：为巧克力囊肿的主要症状，同时也是最容易被忽略的症状表现，为继发性且逐年加重，但也有少数病人无明显的痛经。
(2)月经不调：月经过多，月经血量多，也是巧克力囊肿临床常见症状之一，一般月经周期规律表现为经血过多或带经日久。
(3)性生活痛：这也是一个明显的患病信号，患者还可能会出现滴状的出血，而且常于月经前较为明显。
(4)患不孕症：巧克力囊肿会导致妇女不能怀孕，其不孕率达50%左右，在不孕症女性中，巧克力囊肿所造成的不孕占有很高的比例。
病发机制:1、内分泌因素：卵巢虽然小，但却是生成卵子并排卵、平衡内分泌的重要器官之一，多出现在内分泌旺盛的生育年龄。因此认为和内分泌失调有关。此外月经时生气可能就没了，垃圾排不出来，在卵巢里便形成了囊肿。
2、性生活频繁：通常发病大多是在青春期少女以及更期女性，这和她们过于频繁的性生活有关。
3、输卵管阻塞：卵巢内无受精的卵泡，废品垃圾要排出去，就需要靠体内液压把垃圾排出来，因为机能衰退，输卵管有堵塞现象，排不出去的卵子积在卵巢里，就形成了囊肿。
4、压力过大：是导致卵巢巧克力囊肿的主要因素，长时间精神压力太大、可以导致植物神经功能紊乱、影响内分泌调节，则导致卵巢功能过早衰退，雌激素的分泌减少，提前进入更年期。
可能哪些并发症:
不孕:约有50%左右内异症患者伴有不孕，在不明原因不孕患者中，约30-40%患内异症。内异症患有不孕，常因病变造成盆腔肿块、粘连、输卵管堵塞卵泡发育不好或排卵障碍等因素引起;而一旦怀孕则异位内膜受到抑制而萎缩，对内异症起到很好的治疗，习惯性流产病例中有部分为子宫内膜异位症所致。
痛经:内异症的临床特征为渐进性痛经，是常见而突出的特征，多为继发性，即自发生内膜异位开始，患者诉说以往月经来潮时并无疼痛，而从某一个时期开始出现痛经，可发生在月经前、月经时及月经后。有的痛经较重难忍，需要卧床休息或用药止痛，甚至痛得“滚炕”或撞头，疼痛常随着月经周期而加重，月经结束而消失，但国内报道有21%约无痛经。
周期性直肠刺激症状：进行性加剧的周期性直肠刺激症状罕见于其他妇科疾病，是诊断本症最有价值的症侯。直肠、肛门、外阴部坠胀、坠痛、里急后重感和大便次数增多。当病变逐渐加重时，症状日趋明显，而经后症状消失。
月经不调:内异症患者常有月经周期缩短、经量增多或经期延长等现象，说明患者有卵巢功能障碍表现。月经不调可作诊断参考，但在鉴别诊断中并无价值。
性交痛:当存在于阴道穹窿部异位子宫内膜结节、直肠凹陷结节或粘连，或卵巢粘连在盆底时，均可产生性交痛。阔韧带后叶病灶纤维化增生及收缩明显时，可以外源性压迫输尿管，使其狭窄阻塞，亦可能出现泌尿系统症状，严重的可发生输尿管积水或肾盂积水。
周期性膀胱刺激症状
当内异症病变累及膀胱腹膜反褶或侵犯膀胱肌层时，会同时出现经期尿急、尿频等症状。若病变侵犯膀胱粘膜(膀胱子宫内膜异位症)则有周期性血尿和疼痛。
巧克力囊肿经期或行经前后的急腹症：一般为卵巢子宫内膜囊肿，有穿破的特点，多数患者因卵巢囊肿扭转或宫外孕而急诊手术。若不手术而好转时，盆腔粘连加重，今后还会反复破裂发生急腹症。
周期性下腹不适:本症状的出现率高于痛经，无痛经的内异症患者常存在于本症状。出现于轻症患者，或某些病变虽较重但由于痛阈的个性差异或其他原因，不产生痛经症状而仅有经期腰酸、下腹坠胀不适感。
腹壁疤痕及脐部的子宫内膜异位症则出现周期性局部肿块及疼痛。内在型子宫内膜异位症患者往往子宫胀大，但很少超过3个月妊娠。如为后位子宫，往往粘连固定。在子宫直肠窝、子宫骶韧带或宫颈后壁常可触及1-2个或更多硬性小结节，如绿豆或黄豆大小，多有明显的触痛，肛诊更为明显，这点很重要。卵巢囊肿可长至拳大，由于常有囊肿内容物外溢和异位内膜出血，盆腔脏器粘连加重成冰冻盆腔状，即是所谓广泛内异症。病变程度轻重不同时体征差别很大。
腹膜炎:生长在卵巢的巧克力囊肿，囊壁常常很糟脆，具有一种自发破裂的倾向。囊肿破裂后，小的破口可以很快自行愈合，并与周围组织形成粘连;如果破口较大，则无法自行愈合，其浓稠的巧克力样囊内液可流入腹腔，这种巧克力样液体的刺激性极强，可刺激周围的腹膜，引起剧烈的腹痛，如果处理不及时，还可能导致弥漫性腹膜炎，造成致命的后果。
