1908年2月清廷任命赵尔丰为驻藏大臣，兼任边务大臣，赵尔丰在打箭炉驻兵，加强清政府对西康的控制。由于赵尔丰在川边的改革赢得了清中央的赏识，西藏噶厦深知赵尔丰主藏政，会有改革，于是调集藏兵，意图武力阻止赵尔丰入藏。
1909年赵尔丰挫败进攻巴塘的西藏叛军，并乘胜进入西藏，收复江卡、贡觉等四个部落地区，更越过丹达山向西，一直到达江达宗，此时距离拉萨只有六天的路程，达赖喇嘛逃往英属印度。赵尔丰上书请求乘胜平定西藏全土，并建议在藏区推行革教易俗政策，由于担心其举措过激，为避免事端，清政府没有允许。
1910年赵尔丰与钟颖军会师于查木多，两军迅速推进到工部一线，然后又进入波密地区。赵、钟两军对所到之处的土司头人进行招抚，说服他们建立郡县，之后赵尔丰又收复了三崖（今贡觉、瞻对、波密和白马岗等地）。
赵尔丰素在川边藏区实行改土归流，使川边藏区人民摆脱了数百年来沉重的枷锁，获得了社会相对安定的局面，促进了经济、文教、卫生事业的迅速发展，人民生活得到了改善。同时粉碎了西藏上层统治集团在英帝国主义策划下分裂川边藏区的阴谋，维护了国家的统一，巩固了中国西南国防。
赵尔丰
赵尔丰1845年生于辽宁省辽阳市，正蓝旗人。其父是道光进士，其兄弟尔震、尔巽、尔萃均考取进士，唯赵尔丰屡试不第，只能以纳捐为官，1884年任山西静乐知县，后调永济县令，得山西巡抚锡良赏识，随任于河南。
锡良
1903年锡良调任四川总督，赵尔丰随之入川任永宁道。1905年5月清驻藏大臣凤全在巴塘遇害，赵尔丰被调任建昌道，并受命招募兵勇，赵尔丰派兵入苗沟，屠杀反清的“平会”成员数百人，先后捕杀其首领彭青臣、彭友章，于是得绰号“赵屠户”，这也是其参与和川边藏区相关的事务的开始。
当时由于清政府和驻藏官员对藏区事务的处理不力，致使原本反英的西藏高层统治者转而成为亲英势力，得到英国支持的西藏地方军队也经常在西康和川边地方制造军事冲突，根据这一情况，清政府制定了在川边实行改革藏政和改土归流的政策，意图稳定川边局势。
赵尔丰素来主张武力行事，在凤全被杀后，理塘土司逃至桑披寺，赵尔丰围攻桑披寺长达数月，并切断水源，也未能得手，为此大伤脑筋，后来，有位士兵发现桑披寺的地下引水管道后，该寺才被攻破，然理塘土司却侥幸逃脱，最终隐匿西藏。
由于“改土归流”削弱了土司的权利，遭到土司的武力反抗，所以赵尔丰在数年中几乎是不停地打仗，废除了明正、德格、巴塘、理塘为首的大小土司和昌都、乍丫（察雅）等活佛的政治地位，甚至驱逐了一些西藏地方政府在康区的官员。
赵尔丰
1906年8月22日清政府以“四川、云南两省毗连西藏，边务至为紧要”，决定设立相当于省级建制的川滇边特别行政区，以赵尔丰为川滇边务大臣，其开始在西康进行改土归流的政策。
1907年锡良离任，赵尔丰一度代理四川总督一职，赵尔丰考虑到川边与西藏关系的微妙，筹划了《会筹边务开办章程折》，主张川边与西藏划清界限。赵尔丰考虑到清政府每年给边务开办费银一百万两，额度远不能满足公务需求，因此请求油捐与糖捐两项税务收入作为政府将来的常项收入，协济兵食。
1908年2月朝廷任命其赵尔丰之兄赵尔巽为四川总督，赵尔丰为驻藏大臣，但仍兼任边务大臣，赵尔丰在打箭炉驻兵，改设打箭炉为康定府后又设登科等府，加强清政府对西康的控制。
赵尔巽
清廷要求赵尔丰与联豫会同察度藏情，并拨给赵尔丰白银60余万两，如果不够，由四川总督随时接济。由于赵尔丰在川边的改革赢得了清中央的赏识，西藏噶厦深知赵尔丰主藏政，必会有与川边一样的改革，于是派员前往察木多，调集藏兵，意图武力阻止赵尔丰入藏。
1909年赵尔丰挫败进攻巴塘的西藏叛军，并乘胜进入西藏，收复江卡、贡觉等四个部落地区，更越过丹达山向西，一直到达江达宗，此时距离拉萨只有六天的路程，达赖喇嘛逃往英属印度。赵尔丰上书请求乘胜平定西藏全土，并建议在藏区推行革教易俗政策，由于担心其举措过激，为避免事端，清政府没有允许，但赵尔丰入藏期间仍有大量寺庙被毁。
1910年赵尔丰与钟颖军会师于查木多，迅速推进到工部一线，然后又进入波密地区。赵、钟两军对所到之处的土司头人进行招抚，说服他们建立郡县。之后赵尔丰又收复了三崖（今贡觉、瞻对、波密和白马岗等地）。
赵尔丰对推动川边社会生产力发展所作的贡献，对国家、对民族、对社会所作的贡献。在政治上，废除土司制度，改设流官管理；在宗教方面，抑制寺庙势力的恶性膨胀。在经济上，禁止土司、头人、寺庙放高利贷，严禁炒作买卖土地，废除土司、头人、寺庙的经济特权，废除无偿劳役和各种杂派，鼓励垦荒，兴厂开矿，改善交通，发展邮政，统一度量衡。在教育方面，发展官学，打破了寺庙对于文化教育的垄断。
1909年2月，赵尔丰实施乌拉（农妈）改革，颁布新的《乌拉章程》，要求征乌拉者必须付给一定的费用，俗称脚价。倘有违章苛敛百姓，勒令蛮民支差，不给脚价、口食，一经查出，定予严办，决不宽贷。乌拉改革是清末在川边进行“改土归流”及实施新政的诸多措施中带给百姓利益较多的一项措施，为遭受沉重乌拉支应的藏族百姓减轻了负担。
赵尔丰经营川边藏的数年里，“所收边地（指改土归流），东西三千余里，南北四千余里，设治者三十余区，而西康建省之规模粗具”，为1928年西康的建省打下了坚实的基础。
1911年4月四川总督赵尔巽调任东三省总督，朝廷将赵尔丰调任四川总督。
赵尔丰
当时清政府宣布铁路国有，借“国有”的名义把铁路利权出卖给帝国主义，从而激起了声势浩大的保路风潮，四川的保路运动最为激烈，成立了保路同志会，之后运动遍及全省。
赵尔丰上任后曾一度认为“四川百姓争路是极正常的事”，一面开导民众，一面电恳内阁“筹商转圜之策”，后又参劾盛宣怀，请求朝廷查处盛宣怀。但清廷对赵尔丰等所陈各节，不但置之不顾，反而电饬赵尔丰解散群众，切实镇压。赵尔丰被逼无奈，只能忠实的执行清廷的旨意。
盛宣怀
1911年9月16日赵尔丰召集各营军官训话，部署弹压保路风潮，9月7日他以到督署看邮传部电报为由，将应约而来的蒲殿俊、罗纶等九人诱捕，并在当天下令射杀聚集在四川总督衙门请愿放人的民众，制造了后来所谓的“成都血案” 。
“成都血案”中成都市民尸体
血案发生后，各地同志军闻而起义，四川大半州县被保路同志军攻占，清军处处失利，四面楚歌。川军不愿意接受命令继续镇压，清政府于是派湖北新军入川平定动乱，导致武昌兵力空虚，因此该事件也被认为是辛亥革命的导火线，赵尔丰也因此事件被免去四川总督一职，留任边务大臣。
1911年10月10日武昌起义爆发，11月22日和25日，成都召开四川官绅代表大会，宣布脱离北京政府独立，成立大汉四川军政府，原咨议局议长蒲殿俊任军政府都督，陆军第十七镇统制朱庆澜任副都督。但是12月6日军队突然哗变，蒲殿俊、朱庆澜逃走，军政部长尹昌衡平定叛乱，被推为都督。
尹昌衡
当军队哗变时，应一些绅商的请求下，赵尔丰以总督的名义张帖布告以安定军心，因此事后人们怀疑兵变是赵尔丰指使。1911年12月22日凌晨，尹昌衡指挥所部擒获赵尔丰，并在成都皇城坝召开公审大会公审赵尔丰，当众尽斥其罪，并令部下将赵尔丰当场处决于皇城“明远楼”。《清史稿》称赵尔丰临死前“骂不绝口”。
赵尔丰临刑
