隆庆本是个不喜欢政治的人物，心中对朝臣中的争斗感到很厌烦，读到高拱的奏章，心里虽然觉得有理，但总觉得是多余的事，过去的事，应让他过去，还扯它干什么？
于是他给高拱的奏章来了个不答理，不过，心里也对徐阶有了一分介意。
可是，过了不久，又有广东道试监察御史齐康上了一道奏疏，也是弹劾徐阶的。隆庆不禁心中一动，这徐阶为先朝旧臣，又为内阁首辅，多受言臣官弹劾，岂能作好辅臣吗？他看那奏疏：
广东道试监察御史臣齐康谨奏：臣闻阁臣为陛下股肱，自当竭力报国，忠心事主。今有大学士徐阶不思人臣之道，险邪贪秽，专权蠹国，多有请托干仕，纵容子弟，横行乡里，又先帝往建储，阶坚执不可。及皇上登极，有疑惧心，遂作称病，以尝上意。又与大学士李春芳声势相倚······
这隆庆虽说不喜欢玩政治，但对与他自身密切相关的事，还是很留意的，什么险邪贪秽，纵容子弟，倒没引起他多大的注意，可对弹劾徐阶反对先帝立他为太子，又对他有疑惧之心，引起了警觉。一时他拿不定主意，便将他的旧臣高拱和张居正一并召进宫来。
二人参见已毕，便侍立一旁。隆庆将齐康的奏章给二人作了简要的叙述，就询问他们的意见。
高拱本来对徐阶不满，而齐康的弹劾也本是他指使的，他开口便答道：
“回皇上的话。徐阶身为首辅，专权蠹国，纵容子弟，岂可不察？而他疑惧皇上，讪谤先帝，早就该处斩了！”
高拱当然是巴不得将徐阶趁早赶下台了，而且他对徐阶的仇恨与日俱增。前次在上疏皇上以后，不仅没有将徐阶搬到，反而自己遭到京师、南京两处的言官的猛烈攻击，不是由于他和皇上的特殊关系，差点就叫他卷起铺盖回老家了，
他把这笔账仍然是记在徐阶身上的，指使齐康弹劾，就是他的一次反击。
可张居正的意见不同。他是徐阶的门生，受到徐阶的重用，但他和高拱又是朋友，对高拱的才能学识也非常敬佩。他回答隆庆说：
“少师大学士徐阶，当世宗时，承严氏乱政之后，能矫枉为正，澄浊为清，惩贪墨以安民生，定经制以核边费，扶植公论，奖引才贤，一时朝政修明，官常振肃，海宇称为治平，皆其力也。是时皇上潜居藩邸，世庙一日忽有疑于皇上，阶为之从容譬解，其疑乃释。”
张居正听了隆庆的话，一眼就洞穿了皇上心中的疑虑，那就是徐阶的忠心。居正抓住这一点来解释，说明徐阶并不是反对立他，而且还为嘉靖面前替隆庆辩疑，使他得到了嘉靖的谅解，保全自己的地位。
但是，张居正还不了解，经过差不多一年的时间，隆庆已经对徐阶有了许多不满，他特别讨厌徐阶的劝谏。
隆庆是个喜欢玩乐的人，他爱和女人，爱喝酒，爱和内侍们一起游玩，爱鍪山，爱宫苑，爱秋千，爱龙凤舰，爱金匮玉盘，总之一切的消闲和娱乐他都爱，可偏偏这一切，徐阶都要反对。
惹得皇上大不高兴，连皇上身边的内侍们都不高兴了。特别是前不久的南海祭神，本来这是洪武皇帝以来就定下了的规矩，每遇朝廷大事，应去广东番禺县波罗庙祭奠南海神。隆庆也好趁机出去游幸，偏这徐阶就来阻拦，还指斥皇上身边的太监，尤其是司礼太监李芳，群小乘隙，百方诱惑，渐启皇上玩好之端。
虽然，南海之行成了，隆庆也一肚子不高兴，觉得这徐阶简直把他一个皇帝当成小孩，什么都要管。
隆庆听了高拱和张居正的话，当然觉得高拱的话很合自己胃口，张居正替徐阶的辩解固然能澄清问题，但却消不了他心中的反感。便对二位说道：
“二卿所言，朕再慢慢思考。不过徐阶所为，实多令朕不安，务要他自省才是。”
这一句话就已经够了，一个作臣子的得不到皇上的满意，令一个作皇帝的不安，不就是很危险了吗？
隆庆看了齐康的奏章，拿不定主意，主要还在于看在徐阶的地位上，作了多年的内阁首辅，这朝内朝外，徐阶的门生故吏自然不少，轻易动了他，会在朝中引起不安。
他有意把高拱和张居正找来，正是知道他们同徐阶的不同关系，隆庆想在他们的谈论中寻找一种平衡。现在看来平衡是没有的，他只好索性说出自己的意见。高拱当然很高兴了，可张居正却放不下心了。
二人退出了宫中，张居正就去见了徐阶，将齐康的弹劾讲给徐阶听了，并表示了自己的担忧。徐阶到了这种地步，已知失去了皇上的信任，但又不愿听其自然，而且大臣对高官的弹劾照例是要有听申辩，以求得到皇上的了解。
第二日，徐阶专门进宫见了隆庆皇上，徐阶跪在下面，奏道：
臣徐阶有奏，闻御史齐康弹劾臣过，皆为暧昧隐秘之事。至于说到父子请托，则各部当事之臣，可以召问
隆庆听了，很不满意，心想：既然俱不必辩，你又说他干啥，分明你是恃势欺朕。但他嘴里却说：
“言官所劾，过与不过，朕自有主张。既然卿家以为不必辩，今日进宫又为了何事？”
徐阶知道皇上不满，但又不能不说，只好硬着头皮答道：
“臣所申言在齐康所劾建储一事，尤为妄诞。臣曾在礼部，四次上疏请立东宫，不报。及备员内阁，先帝尝问及传继，于时恐起他隙，以故不敢赞成。而皇上之仁孝，曾恳恳为先帝陈之，至今交进御扎及臣所藏，皆可查对，亦何待臣之辨而后明也。”
隆庆待他说完，冷笑说道：
“徐卿既屡称不待辩而明，而又屡辩之，朕都糊涂了，究竟是明还是不明？”
一句话问得徐阶哑口无言，心中才知这皇上存心为难，一时的聪明都不知到哪里去了。不过徐阶心里是明白的，强辩只能将事情越弄越糟，特别是面对一个有意为难的皇上。
徐阶沉默了，静静伏在下面，他只好以静观动。
可隆庆今天要主动出击，他已经抓住了徐阶的把柄了。“你既申言齐康弹劾建储一事，尤为妄诞，礼部之时曾四次上疏建立东宫，又不闻报。而先帝问及传继，又不敢赞成。朕今问你，这不赞成之事，可是建储之事？”
徐阶这时已经只有招架之功了，这是自己申辩时所说的，难道还能抵赖？只好答道：
“正是！”
“好了，既不赞成，又怎得申责齐康所劾为妄诞？”
隆庆毫不客气地说。这句话，令徐阶背上都冒出了微微的冷汗，按隆庆的解释，徐阶知道，那就是反对立储的证
据。而一个在位的皇帝，知道他的首辅大臣当初就是反对立他为太子的人，结果将是什么？徐阶心中能不畏惧吗？原来是想进宫解释，谁知越解释越糊涂，徐阶隐隐感到了问题的严重。
但是，保护自我的本能又促使他不得不说：
“皇上英明，当时为臣不敢赞成，乃是因为恐起他隙。”
“恐起他隙？”隆庆重复着，“恐起什么样的他隙，你说说！”
徐阶此时真是进退维谷。他能说吗？嘉靖相信二龙不相见的话，他自己不愿册立太子。说了出来，岂不是有诬先帝？尽管事实就是如此，可就是不能说。但既已说出了口，不回皇上的话，又是不是欺君的罪呢？
盘桓再三，徐阶只能选择现实，只好把责任推到道士陶仲文身上，说：
“当初陶仲文蒙惑先帝，说二龙不能相见。如果册立东宫，又会有不测！”
徐阶冒着冷汗把话说完，却听得隆庆一声喊：
“大胆徐阶，你竟敢厚诬先帝，陷朕不恭！当初，朝臣奏 你草拟遗诏，毁谤先帝，朕还不信，今日看来，你果是如此！”
徐阶一惊；他还从没听见过隆庆这样说话。他还能说什么呢？一切都是自己说出来的，还能怨得别人吗？心里只有叹息，他这才体会到：政治真是个陷阱，当初他给别人设计过不少，可如今该轮着他自己了，而避免得了的，并不是靠的才能。
徐阶致仕了。十七年的大学士，七年的首辅，徐阶的政治生涯结束了。它的起因和它的结局，都钉在嘉靖四十五年的遗诏上。
