1988年7月13日，纪登奎因病在北京去世，享年65岁。

8月3日，《人民日报》在第四版中部以较大篇幅发了一篇题为《党和国家领导人向纪登奎遗体告别》的消息，刊登了纪登奎的遗像。

在这篇消息下面，又发表了一篇1000余字的《纪登奎同志生平》。文中称呼纪登奎是“优秀的中国共产党党员，忠诚的共产主义战士”，并具体提到：

“1983年他任国务院农村发展研究中心研究员以来，经常深入农村，深入基层，深入实际，调查研究，对农村的改革和发展，提了不少积极的建议纪登奎同志思想敏锐，办事果断，作风深入，艰苦朴素，廉洁奉公，平易近人，虚心好学，勇于开展批评和自我批评。他参加革命工作50多年，为中国人民的革命和建设事业做出了贡献。”

如此，算得上是盖棺定论，不过值得一提的是，文中未提及纪登奎的错误，与此同时对于纪登奎的一些特殊任职经历也未有提及。

纪登奎早年间在河南长期工作，不过他的老家却不是河南，而是山西武乡。毛主席时代山西籍的副总理一共有五位，纪登奎便是其一，另外4位分别是薄一波、徐向前、华国锋（后来曾任总理）和陈永贵。

而之所以说纪登奎的任职经历特殊，正因为他在还只是一个基层宣传干部的时候，就有了见到毛主席的机会，并凭借出色的工作汇报能力被毛主席记住，一步步进到中央政治局候补委员、国务院副总理。

后来他主动辞职，1982年经早年战友赵紫阳提议去到国务院农村发展研究中心工作，国务院副总理自然是他生平最高任职，不过在《纪登奎同志生平》中却未提及。

这样的安排，固有其深意。所以对此，纪登奎的家属也并未有争辩，他们唯独提了一条意见，便是有关纪登奎的军旅生涯未见记载，希望能够补足。

但回顾纪登奎的前半生，他15岁参加革命，16岁入党，先后经历过解放战争和抗日战争，建国后按通常说法算得上是个“老八路”，但他实际很少做军事工作，并没有正儿八经带兵打过仗。

纪登奎曾经回忆起来也说，他打过的仗只是指挥地方武装部队去剿匪，战争的规模并不算大，经他指挥的部队也不算多，顶多算是指挥过一个团的“地方部队”。

那为什么纪登奎的家属会提出希望补足有关纪登奎的军旅生涯呢？

原来70年代纪登奎去到北京工作后，曾出任军职。

1970年12月，毛主席特别委任李德生为北京军区司令员，纪登奎为北京军区第二政委。虽说是第二政委，但由于第一政委谢富治身体原因，纪登奎实际主持北京军区的政治工作，并于1971年正式兼任北京军区第一政委。

当时毛主席这样做的目的，便是派自己最信任的两个干部守住北京这个重要的阵地。

在纪登奎上任之前，毛主席便把军委办事组成员都召集来，当面对他们说：

“你们这个军委办事组啊，像粘土一样，板结了，不透气了，需要掺沙子。已经掺了一个李德生，看来还不够。我给你们再派个文官，我的老朋友，纪登奎。”

毛主席毫不避讳，派纪登奎这样一个长期从事地方工作的领导干部出任高级军职，就是为了“掺沙子”。

这在当时也是不得已的事情，而正是这个难得的机会，也使纪登奎获得了许多军队方面和军事上的知识，先后参与了军队许多重大问题的决策，并先后与李德生、陈锡联、叶剑英等共和国开国将帅共事过。

纪登奎的长子纪坡民回忆起来，按父亲的话说，就是他“和军队的老总们一起混了七八年”。

后来针对于此，纪坡民向中组部反映，希望详实其事。而中组部对此也很重视，在经过反复核实后，最终在《纪登奎同志生平》一文中补足了纪登奎的军职经历，从而令其生平愈加完整。