在伊尹的帮助下，汤国终于改朝换代，改组为商王朝。商代初期，百废待兴，经伊尹协助，制定了各种法令，很快就把商代的治安整顿得井井有条，井然有序。商汤统治了三十多年，在他死前，将伊尹托付给了他，让他帮助自己的儿子成为下一任皇帝。在商代，兄弟相残，兄弟相残，兄弟相残，兄弟相残。商无兄弟，故当以长子泰丁代为王位。但当汤公还活着的时候，他已经去世，所以从礼仪上来说，他的哥哥，就是他的哥哥，也就是他的哥哥。所以伊尹就支持了皇子殿下。皇子三年后去世，其兄仲壬继承皇子之位，但仲壬体质孱弱，又是一个短命者，只坐了四年便病逝了。现在唯一有资格成为国王的人就是太甲，他是商汤的孙子，也是太丁的儿子。而伊尹也没有丝毫迟疑，立即就将年纪尚小的他推上了皇位。他亲自执掌朝政，兢兢业业地在一旁协助，教导他明辨是非。

太甲年纪轻轻，什么都不懂，一开始他还听从了伊尹的吩咐，遵守了先祖定下的规矩，在政务上尽职尽责。但他从小就走到了权力的巅峰，被人捧在手心里，又因为从小没有父亲，所以没有受到太多的管束。短短数年间，他调皮捣蛋的性子便越发地猖狂，以为自己已经成为了一方霸主，高高在上，谁都无法约束他，甚至连伊尹的指点都有些不耐。他认为伊尹虽然贵为丞相，但毕竟是个奴才，为何要自己听从他的说教，所以，伊尹拿着先祖遗训，拿着汤家定下的律令，拿着历代圣王的事迹来教导他，他完全不理会，甚至还充满了敌意。慢慢地，他开始放纵自己，纵情享乐，酗酒饮酒，屡次打破礼仪。而且，他越来越和夏桀一样，仗势欺人，残暴，让人痛不欲生，对他的怨恨，也是越来越多。伊尹等文武百官都很担心，因为他的野心太大，行事太过霸道，所以不断地叮嘱他，让他知道自己是一位君王，什么时候该做，什么时候不该做。但是伊尹的话，他却是充耳不闻，非但没有阻止，反而越来越过分。伊尹很是焦急，生怕任由太甲这么折腾，自己辛辛苦苦打下的江山，就会毁于一旦。

伊尹想要将大商培养成为一位英明的君主，所以她打算给大商一顿毒打。马上就是汤公的死期了，按照惯例，国主要带着全宫的人去祭拜。而伊尹却一而再再而三地说，作为汤族的后裔，他必须要接受汤族的统治，哪怕他不愿意当这个皇帝，他也必须接受。太甲没有办法，只好勉强举行葬礼，并率领大臣们前往汤显祖的陵寝--童子宫中。祭祀之初，伊尹朗诵一篇祭文，对死后的大汤之魂说：“为商之长存，请小君于通天宫中，以求大君反省，以求大君明理，以明君之道。”听到这段话，他才意识到自己即将被关进通天殿，被严刑拷打，心中一阵慌乱，但是满朝文武都在这里，所有人都站在伊尹这边，他也没有退路，不得不遵从。太甲虽然被安置在了通天殿中，但是朝堂上的事情还是要有人来处理的，所以伊尹就成了朝堂上的执掌者，取而代之。伊尹曾为他写下《伊训》中的《肆命》与《祖后》中的三句话：《伊训》中的一句话，贪欲是亡国的根源，作为一个君主，要保证一个国家的长久稳定，就必须要学会自律，听取大臣们的忠告。《肆命》则是论辨对错之道，明确指出哪些事该作，哪些事不该作；《祖后》一书，讲述的是商朝和汤朝的法律，告诫他不要违背先祖的律令，不要因为自己的一己私利，而违背先祖的律令。

桐宫位于商都城郊，虽然是大商始祖汤王的坟茔，但也十分简单，和一般人的坟茔无异，只是建了一个低矮的殿堂，供人们年年来祭祀。而对于习惯了享受的他来说，又怎么可能忍受得了这样的痛苦。伊尹为了让他痛改前非，诚恳地说道：我年纪大了，本来已经无心争夺皇位，但祖上将我托付给我，让我帮助年轻的君王，我肩负起了很大的责任。我不能让你自生自灭，也不能让你自生自灭。你虽为商之主，但为政之先，当多读书，走正道，修养己身，以增强治国之才。因此，我要借此良机，在此向陛下学习，怎样才能成为一代明君。太甲也明白这件事情无法改变，而且伊尹的那句话也打动了他，所以也就没有再坚持，而是乖乖地留在了这里，继续在这里读书。在这里，太甲什么都没有他的日子很简单，他每天都要去看一看爷爷的坟头，看一看伊尹的教诲，这让他的内心变得无比的宁静。他渐渐明白了自己的爷爷历经千辛万苦，才把大商建立起来，还能节衣缩食，立德仁义。这让他对爷爷佩服得五体投地，又想到自己没有为国出力，就登基为君，不思治理，反而享福。又以残暴的手段残害子民，实在惭愧。同时，他也想起伊尹费尽心机教导自己，结果自己听不懂，心中充满着遗憾。所以，他下定决心，一定要努力学习，成为一代英明的君主，他要学会治国，学会治国，学会治国，学会处理国事。

就在这种忘我的状态下，他在这座宫殿里呆了三年之久。这三年来，他真的是洗心革面，向自己的爷爷看齐，对自己的道德修养非常的严格。伊尹也时常派遣一些有才华有才华的人，来教导安林，顺便打听一下安林在这座宫殿里的事情。从这一点上，他可以肯定，太甲是真的洗心革面，有能力重新成为一国之君。伊尹率领群臣，前往通天殿，举行盛大的典礼，将太甲派往亳国，由他掌管国事，他只是在一旁协助。三年的时间，他已经彻底的改变了自己的性格。他年纪虽小，但为人老成持重，在国事上从来不会有丝毫松懈，更继承了商王朝的美德，为百姓谋福利，处处以大局为重，从来没有违背过先祖遗训，也没有违背过王法。在伊尹与他的共同努力下，大商国泰民安，各大势力纷纷效忠，大商国泰民安，迎来了一段平稳发展的盛世。据《史记·殷本纪》记载，在泰甲王夺回王位之后，“诸王皆归于殷人，民宁矣。”因此，他在朝野上下都很受尊重，人们都叫他“太宗”。伊尹还写了三部《太甲训》，歌颂了他的仁义治国。

但在泰甲统治时期，依然是伊尹在泰甲之子沃丁登上王位后第八年就去世了。传说，在他死后，天空中出现了一片迷雾，迷蒙了三天。沃丁感激他为商所作的贡献，便为他操办葬礼，以皇帝的礼仪把他埋入深山，并把他埋在了亳州城外。伊尹不但是帮助商朝一统天下的始祖，更是当之无愧的“五朝元老”他的才能和对大商的忠诚，使大商六百余年的繁荣奠定了基础，被尊称为“元圣”，是中国历史上最早的一个有作为的大臣。根据甲骨上的文字，伊尹不仅被排在第一位，作为“旧老臣”被举行了盛大的仪式，还和汤公一起举行了一次独立的仪式。